您好,欢迎访问云南省农业科学院 机构知识库!

云南花生丛枝植原体16S rRNA和核糖体蛋白基因序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 万琼莲 1 ; 杨子祥 2 ; 王连春 1 ; 蔡红 1 ; 陈海如 1 ;

作者机构: 1.云南农业大学植物病理重点实验室

2.云南省农业科学院热区生态农业研究所

关键词: 云南元谋花生丛枝;植原体;16S rDNA;核糖体蛋白基因;序列分析

期刊名称: 植物病理学报

ISSN: 0412-0914

年卷期: 2014 年 44 卷 04 期

页码: 370-378

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用植原体16S rRNA基因及核糖体蛋白基因(ribosomal protein,rp)通用引物对发生在云南元谋的花生丛枝病病株DNA进行PCR扩增,并对扩增片段进行序列测定。扩增获得的云南元谋花生丛枝植原体(PnWB-YNym)16S rDNA、16S-23S rDNA和23S DNA片段总长1 806 bp,rp基因扩增片段长1 171 bp。云南株系与来源于台湾和海南的花生丛枝植原体均有较高同源性。比较16S rDNA片段,发现云南株系在5个位点上与来自台湾或海南的株系存在碱基差异,其中有1个位点的差异是云南元谋株系特异的;再分别比较核糖体蛋白rplV-rpsC 2个基因所编码的氨基酸序列,发现云南株系rpsC编码的第194位氨基酸与台湾和海南的株系存在差异。经16S rDNA片段系统进化及iPhyClassifier在线分析,表明PnWBYNym在分类上属于16SrII-A亚组成员,与候选种‘Cand/datus Phytoplasma australasiae'相关;基于rp基因构建的系统进化树表明,PnWB-YNym与16SrII-A亚组各成员聚为同一亚进化支(iii)。

  • 相关文献

[1]云南蔓草虫豆丛枝植原体16S rDNA和secY基因序列分析. 王柱华,刘俊男,杨子祥,赵宇,蔡红,陈海如. 2018

[2]云南保山蔗区首次检测发现检疫性病害甘蔗白叶病植原体. Huang Ying-kun,黄应昆,李文凤,Li Wen-feng. 2014

[3]温水处理对甘蔗白叶病植原体的脱除效果研究. 单红丽,李文凤,黄应昆,王哓燕,张荣跃,罗志明,申科,尹炯. 2013

[4]云南西盟蔗区发现检疫性病害甘蔗白叶病. 张荣跃,李文凤,黄应昆,王晓燕,单红丽,李婕,仓晓燕,罗志明,尹炯. 2019

[5]云南芝麻丛枝和花变叶植原体16S rRNA和rp基因序列分析. 苏帆,杨子祥,王柱华,万琼莲,何孟兰,毛清源,蔡红. 2021

[6]耿马甘蔗白叶病植原体昆虫介体调查与检测. 李文凤,王晓燕,仓晓燕,张荣跃,单红丽,卢文洁,王长秘,尹炯,黄应昆. 2022

[7]甘蔗白叶病植原体PCR检测方法的建立与应用. 张荣跃,马永德,李婕,王晓燕,单红丽,李银煳,黄应昆. 2023

[8]组培法保存花椰菜丛枝植原体的初步研究. 万琼莲,木万福,张茹岚,王连春,蔡红. 2016

[9]黄槐丛枝病植原体的检测及鉴定. 蔡红,李小林,孔宝华,陈海如. 2005

[10]我国植物支原体类病害的种类. 蒯元璋,张仲凯,陈海如. 2000

[11]云南小驳骨丛枝植原体的分子鉴定及相关基因序列分析. 许杏萍,苏帆,杨子祥,刘俊男,万琼莲,蔡红. 2021

[12]基于16S rDNA序列分析研究根腐病三七根内可培养细菌的多样性. 张智慧,张倩茹,付晓萍,李凌飞. 2014

[13]云南省四个草地贪夜蛾种群肠道细菌群落多样性及差异分析. 刘莹,赵雪晴,尹艳琼,李向永,陈福寿,张红梅,王燕,谌爱东. 2021

[14]稻瘟病抗性对根际土壤微生物多样性的影响. 张翠,孙一丁,马继琼,杨奕,郭怡卿,李进斌,许明辉. 2022

[15]滇龙胆GrWRKY5基因的克隆和植物表达载体构建. 王彩云,李富生,李涛,李彩霞,张晓东,王元忠. 2015

[16]元江普通野生稻金属硫蛋白(YJMT-2)的获得及序列分析. 史冬燕. 2009

[17]家蚕微孢子虫感染对家蚕海龟蛋白(Bmtutl)基因表达水平的影响. 朱峰,高建华,张永红,肖圣燕,邵榆岚,唐芬芬,白兴荣. 2019

[18]稻瘟病抗性基因Pita在中日韩粳稻中的分布. 马继琼,孙一丁,杨奕,李进斌,许明辉. 2020

[19]琥珀蚕胆绿素结合蛋白基因AaBP-1的克隆及表达分析. 李琼艳,陈安利,钟健,刘增虎,廖鹏飞,杨伟克,董占鹏. 2019

[20]番木瓜环斑病毒南瓜分离物外壳蛋白基因的克隆及序列分析. 杨国慧,张仲凯,崔崇士. 2007

作者其他论文 更多>>