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云南花生丛枝植原体16S rRNA和核糖体蛋白基因序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 万琼莲 1 ; 杨子祥 2 ; 王连春 1 ; 蔡红 1 ; 陈海如 1 ;

作者机构: 1.云南农业大学植物病理重点实验室

2.云南省农业科学院热区生态农业研究所

关键词: 云南元谋花生丛枝;植原体;16S rDNA;核糖体蛋白基因;序列分析

期刊名称: 植物病理学报

ISSN: 0412-0914

年卷期: 2014 年 44 卷 04 期

页码: 370-378

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用植原体16S rRNA基因及核糖体蛋白基因(ribosomal protein,rp)通用引物对发生在云南元谋的花生丛枝病病株DNA进行PCR扩增,并对扩增片段进行序列测定。扩增获得的云南元谋花生丛枝植原体(PnWB-YNym)16S rDNA、16S-23S rDNA和23S DNA片段总长1 806 bp,rp基因扩增片段长1 171 bp。云南株系与来源于台湾和海南的花生丛枝植原体均有较高同源性。比较16S rDNA片段,发现云南株系在5个位点上与来自台湾或海南的株系存在碱基差异,其中有1个位点的差异是云南元谋株系特异的;再分别比较核糖体蛋白rplV-rpsC 2个基因所编码的氨基酸序列,发现云南株系rpsC编码的第194位氨基酸与台湾和海南的株系存在差异。经16S rDNA片段系统进化及iPhyClassifier在线分析,表明PnWBYNym在分类上属于16SrII-A亚组成员,与候选种‘Cand/datus Phytoplasma australasiae'相关;基于rp基因构建的系统进化树表明,PnWB-YNym与16SrII-A亚组各成员聚为同一亚进化支(iii)。

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