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甘蔗SSR和AFLP分子遗传连锁图谱构建

文献类型: 中文期刊

作者: 刘新龙 1 ; 毛钧 1 ; 陆鑫 1 ; 马丽 1 ; Karen Sarah AITKEN 2 ; Phillip Andrew JACKSON 2 ; 蔡青 1 ; 范源洪 1 ;

作者机构: 1.云南省甘蔗遗传改良重点实验室

2.澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)植物研究中心

关键词: 甘蔗;遗传连锁图谱;SSR;AFLP;群体

期刊名称: 作物学报

ISSN: 0496-3490

年卷期: 2010 年 36 卷 01 期

页码: 177-183

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用甘蔗商业品种Co419与野生种割手密Y75/1/2杂交,获得269个单株,组成F1群体,用F102/356与商业品种ROC25回交获得266个单株,组成BC1群体。利用筛选的多态性条带丰富的36对SSR引物和12对AFLP引物,对两个群体进行PCR扩增和分子遗传连锁分析,构建甘蔗分子遗传连锁图谱。用F1群体获得630个分离标记,经χ2检测,298个标记为单双剂量标记,占总标记数的47%;用BC1群体获得571个分离标记,有264个标记为单双剂量标记,占总标记数的46%;4个亲本获得单双剂量标记的数量依次为Co419>02/356>Y75/1/2>ROC25。在LOD≥5.0,相邻标记遗传距离≤40cM的条件下,F1群体有134个单双剂量标记被纳入55个连锁群,其中39个连锁群归属8个同源组,16个未列入,总遗传距离为1458.3cM,标记间平均图距为10.9cM;BC1群体有133个单双剂量标记被纳入47个连锁群,其中34个连锁群归属于8个同源组,13个连锁群未列入,总遗传距离为1059.6cM,标记间平均图距为8.0cM。从4个亲本单双剂量标记进入的连锁群数来看,Co419最多,归入34个连锁群,其次为Y75/1/2,归入20个连锁群,第3为02/356和ROC25,归入19个连锁群。研究结果表明,从单双剂量标记比例、形成连锁群数量、总遗传距离来看,F1群体构图质量要优于BC1群体。

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