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贵州地方水稻品种抗稻瘟病基因Pita功能区段序列变异分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨奕 1 ; 马继琼 1 ; 孙一丁 1 ; 许明辉 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室

关键词: 地方水稻品种;稻瘟病Pita基因;测序分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2018 年 13 期

页码: 4129-4137

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了揭示贵州水稻地方品种Pita基因序列变异类型和地理分布特点,以贵州省收集到的91份地方水稻品种为供试材料,设计抗稻瘟病Pita基因特异引物对Pita基因第二编码区功能位点区段进行PCR扩增及测序分析。研究表明,91份贵州地方水稻均持有抗稻瘟病Pita基因,DNA序列存在6个变异位点,氨基酸序列存在4个变异位点,归为7种DNA单倍型和5种蛋白型,其中Pita-H1(63.74%)、Pita-H2(18.68%)的频率较高,是贵州的优势单倍型,其他单倍型频率较低。携带Pita抗性基因(编码区第2 752位功能位点碱基为G)的品种仅6个,占供试材料的6.59%,且与越南抗性品种Tetep序列一致。Pita抗性基因在贵州省广泛分布不平衡,且频率较低。本研究为挖掘和利用贵州地方稻种的抗稻瘟病基因资源提供了参考。

  • 相关文献

[1]云南野生稻抗稻瘟病Pi-ta基因的检测及分析. 赵国珍,蒋春苗,刘吉新,陈于敏,余腾琼,程在全. 2014

[2]基于PacBio平台的紫娟茶树全长转录组分析. 夏丽飞,孙云南,宋维希,朱兴正,田易萍,蒋会兵,陈林波. 2020

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