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滇黑两省黄瓜花叶病毒南瓜分离物外壳蛋白基因序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 杨国慧 1 ; 张仲凯 2 ; 崔崇士 1 ;

作者机构： 1.东北农业大学园艺学院

2.云南省农业生物技术重点实验室

关键词： 南瓜;CMV;IC-PCR;CP基因

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2006 年 33 卷 06 期

页码： 1237-1240

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用免疫捕捉多聚酶链式反应(Immuno-Capture PCR,IC-PCR)方法从南瓜的两个黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)云南分离物(CMV-YN)和黑龙江分离物(CMV-HLJ)中扩增获得约700bp的外壳蛋白(Coat protein,CP)基因片段,并克隆到pGEM-T载体中。核苷酸序列测定表明,CMV-HLJ和CMV-YN两个分离物CP基因长为657bp,编码219个氨基酸,两个分离物的核苷酸和氨基酸同源性分别达到96.8%和97.4%。和国外CMV亚组Ⅰ6个分离物核苷酸序列同源性在90%以上,氨基酸同源性在97%以上,和亚组Ⅱ6个分离物的同源性分别为66.4%和73.4%。和国内亚组Ⅰ10个分离物的核苷酸同源性都在89.5%以上,氨基酸同源性在93%以上,而和亚组Ⅱ两个分离物的同源性分别为68.3%和73.5%。序列分析结果表明CMV-HLJ和CMV-YN两个分离物属于CMV亚组Ⅰ。

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