文献类型: 中文期刊
作者: 王浩 1 ; 孙亮 1 ; 张济民 1 ; 贾文杰 1 ; 吴雅文 1 ; 张小平 1 ; 李想 1 ; 王有国 1 ;
作者机构: 1.云南农业大学园林园艺学院;金华职业技术学院农学院;云南省农业科学院花卉研究所
关键词: 百合(Lilium spp.);LoERF4;基因克隆;生物信息学分析
期刊名称: 云南农业大学学报(自然科学)
ISSN: 1004-390X
年卷期: 2022 年 06 期
页码: 1021-1030
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】研究AP2/ERF家族成员ERF基因在百合休眠解除过程中的作用。【方法】以百合品种西伯利亚(Lilium oriental ‘Siberia’)的小鳞茎为试验材料,从前期试验获得的转录组测序数据中筛选得到1个在小鳞茎休眠解除过程中显著上调表达的ERF转录因子,结合RT-PCR技术扩增得到西伯利亚小鳞茎的ERF基因c DNA全长序列,命名为LoERF4;通过多种生物信息学软件对LoERF4的基因结构和理化性质等进行分析;利用荧光定量qRT-PCR技术检测LoERF4基因在小鳞茎休眠解除过程中的相对表达量。【结果】通过克隆得到LoERF4基因全长,该基因开放阅读框全长为606 bp,编码201个氨基酸,含有1个典型的保守AP2结构域;蛋白相对分子量约为21.52 ku,理论等电点为6.43,为亲水性蛋白,没有跨膜结构。qRT-PCR分析结果显示:在西伯利亚小鳞茎休眠解除过程中,该基因的表达量在第20天小鳞茎休眠解除、开始萌发时极显著升高。【结论】在百合中克隆得到的LoERF基因可能是参与调控百合小鳞茎休眠解除进程的关键因子之一。
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