文献类型： 中文期刊
作者： 郑宽瑜 1 ; 董家红 1 ; 苏晓霞 1 ; 方琦 1 ; 郑雪 1 ; 张仲凯 1 ;
作者机构： 1.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室和农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室
关键词： 番茄斑萎病毒属;非结构蛋白;NSs;生物信息学
期刊名称： 西南农业学报
ISSN： 1001-4829
年卷期： 2014 年 27 卷 02 期
页码： 646-651
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 番茄斑萎病毒属(Tospovirus)病毒编码的非结构蛋白NSs,可能在病毒复制、转录、抑制RNA沉默中起重要作用,本文利用生物信息方法对21个Tospovirus病毒成员的NSs序列进行分析,为进一步研究NSs的功能提供参考信息。从GenBank数据库中下载NSs基因序列,用DNAMAN5.0做NSs相似性矩阵分析,发现一些Tospovirus病毒成员之间的NSs氨基酸序列相似性很低,最低仅为7.1%;用ClustalX2.1进行NSs的氨基酸多序列比对分析,发现Tospovirus病毒成员的NSs相对保守区主要位于NSs的C端的位置,高度保守的氨基酸位点共有9个;PROSITE对NSs进行模体预测分析,结果显示Tospovirus病毒NSs共有的蛋白修饰:C蛋白激酶磷酸化、酪蛋白激酶II磷酸化和N-酰基化。此外,不同种的Tospovirus病毒NSs模体也表现出了多样性的特点。预测结果为下一步研究NSs功能奠定了基础。
- 相关文献
[1]从云南蝴蝶兰上检测到番茄斑萎病毒属病毒. 程晓非,董家红,方琦,李婷婷,丁铭,张仲凯. 2008
[2]侵染水鬼蕉和花朱顶红的番茄斑萎病毒属病毒的电镜和DAS-ELISA诊断. 方琦,董家红,丁铭,尹跃艳,张丽珍,李婷婷,苏晓霞,李展,张仲凯. 2011
[3]云南澳洲坚果苗木感染番茄斑萎病毒属病毒初报. 方琦,丁铭,董家红,尹跃艳,张磊. 2013
[4]番茄斑萎病毒属(Tospovirus)病毒在云南的发生分布研究初报. 张仲凯,丁铭,方琦,张丽珍,李婷婷,彭潞波,苏晓霞,李展. 2004
[5]云南冬季蔬菜病毒的主要种类. 张仲凯,丁铭,董家红,罗延青,程晓非,方琦,李婷婷,苏晓霞. 2006
[6]番茄环纹斑点病毒非结构蛋白NSs的原核表达及多抗血清制备. 郑宽瑜,董家红,尹跃艳,方琦,苏晓霞,张仲凯. 2015
[7]番茄斑萎病毒2个非结构蛋白VIGS体系的初步构建. 杨婷婷,赵立华,邱润霜,陈思,张洁,李博文,张仲凯,马长乐. 2022
[8]中华蜜蜂气味结合蛋白基因AcerOBP14的克隆及时空表达. 杜亚丽,张中印,潘建芳,王树杰,杨爽,赵慧婷,姜玉锁. 2016
[9]蓖麻NAC转录因子家族的鉴定及生物信息学分析. 代梦媛,高梅,李文昌. 2020
[10]植物抗白粉病MLO基因研究进展. 田永贤,陈敏,王其刚,张颢,邱显钦. 2020
[11]猪睾丸表达序列37(TEX37)克隆、mRNA表达及蛋白质功能生物信息学分析. 霍海龙,张霞,范俐,赵筱,王世雄,王荣琼,刘丽仙,霍金龙. 2020
[12]蓖麻GRF转录因子家族生物信息学鉴定及表达分析. 代梦媛,高梅,李文昌. 2021
[13]基于长尖叶蔷薇与大花香水月季转录组数据的MLO unigenes生物信息学及表达分析. 向贵生,张颢,王其刚,晏慧君,周宁宁,陈敏,唐开学,邱显钦. 2018
[14]苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析. 杨晓琳,段迎,蔡苏云,贺润丽,尹桂芳,王艳青,卢文洁,孙道旺,王莉花. 2022
[15]猪雄性增强抗原1基因MEA1编码区克隆、表达及生物信息学分析. 霍海龙,张霞,范俐,赵筱,唐宏涛,高林青,王世雄,杨云,浦仕飞,刘丽仙. 2018
[16]蒜芥茄SsVe1和SsVe2基因的克隆及表达分析. 吴丽艳,尹梦莹,念润,黎志彬,鲍锐,董相书,龚亚菊,杜光辉. 2021
[17]玫瑰与烟草间作对烟叶蛋白质影响的生物信息学分析. 徐洁,余萍,董超,朱海滨,张静,杨义,罗云,姚春馨,陶南. 2016
[18]蓖麻DNA甲基转移酶序列与基因表达分析. 代梦媛,高梅,郭丽芬,邓剑川,李文昌. 2016
[19]峨眉蔷薇Ro-DREB1C的克隆与生物信息学分析. 周宁宁,王俊云,李淑斌,陈敏,张颢,王其刚. 2018
[20]西方蜜蜂Sirtuin蛋白家族基因鉴定及表达分析. 宋文菲,刘娜,苗春辉,余玉生,胡宗文,王艳辉,李亚辉. 2023
作者其他论文 更多>>
-
侵染云南早春西瓜的西瓜银色斑驳病毒和黄瓜花叶病毒分离鉴定
作者：杜雨濛;赵立华;张绍智;王田田;张仲凯
关键词：早春西瓜;西瓜银色斑驳病毒;黄瓜花叶病毒;复合侵染;种子
-
云南两个花魔芋主产区软腐病害植株腐烂球茎中的菌群组成及特征
作者：张绍智;田庆红;董坤;杨丽萍;殷减清;张仲凯
关键词：花魔芋;宏基因组;软腐病;病原菌;微生物群落
-
光照胁迫对滇黄精多糖代谢酶活性的影响
作者：徐哲;王进;郭兰萍;朱新焰;张磊;董家红;季鹏章
关键词：光照胁迫;滇黄精;多糖;蔗糖代谢酶
-
云南怒江番茄种植新区番茄病毒检测及病毒种传特性
作者：刘玉莹;熊志琦;苏晓霞;王田田;吴阔;郑宽瑜;张仲凯
关键词：番茄;番茄病毒;病毒检测;RNA-seq;种传病毒
-
番茄环纹斑点病毒核衣壳蛋白N的RT-LAMP检测方法的建立
作者：罗海燕;李恒;陆承聪;魏辉;郑雪;陈勇
关键词：番茄环纹斑点病毒;核衣壳蛋白N;逆转录环介导等温扩增技术;检测
-
侵染鸢尾的番茄斑萎病毒鉴定
作者：忽靖宇;阙开娟;缪田丽;吴少政;王田田;张磊;董鲜;季鹏章;董家红
关键词：鸢尾;番茄斑萎病毒;N基因;NSs基因
-
番茄环纹斑点病毒N和NSm基因的VIGS载体构建
作者：崔玥;赵立华;陈思;文俊元;邱润霜;张仲凯;赵明富
关键词：番茄环纹斑点病毒;病毒诱导的基因沉默;实时荧光定量PCR;烟草脆裂病毒
