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野生稻Wx基因(CT)n卫星序列和第一内含子SNP特征标签初探

文献类型： 中文期刊

作者： 王炎炎 1 ; 孙一丁 1 ; 马继琼 1 ; 杨奕 1 ; 许明辉 1 ;

作者机构： 1.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室

关键词： 野生稻;Wx基因;SNP

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2016 年 35 卷 12 期

页码： 3458-3464

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究利用特异引物对来源于云南的22份栽培稻及分别来源于海南、云南元江、江西东乡的3份普通野生稻(O.rufipogon Griff.)和1份长雄野生稻(O.longistaminata)Wx基因中第1内含子和第1内含子上游微卫星序列(CT)n的序列进行PCR扩增并测序。结果显示所有材料均能扩增出产物并获得碱基测序(包括长雄野生稻),4份野生稻的(CT)重复次数分别是(CT)8、(CT)10、(CT)10、(CT)11,较栽培稻少;第1内含子中+1位碱基均为G。相较于栽培稻,野生稻在第1内含子与(CT)n重复中有明显区别于栽培稻的SNP位点,包含基因突变的In Del、转换和颠换3种类型。说明野生稻和栽培稻在进化的过程中出现了差异。Wx基因中微卫星序列(CT)n和第1内含子的序列可作为检测野生稻遗传组分的一个遗传标签。

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