您好,欢迎访问云南省农业科学院 机构知识库!

贵州禾落粒性基因qSH1调控区SNP分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨奕 1 ; 马继琼 1 ; 孙一丁 1 ; 许明辉 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所云南省农业生物技术重点实验室农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室

关键词: 贵州禾;落粒性;qSH1;序列分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2021 年 006 期

页码: 1910-1918

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 贵州禾是在贵州省黔东南地区种植的一类特殊的稻种,为探究其遗传特性,本研究对49份贵州禾和来源中国11个省市(自治区)和韩日的112份稻种的落粒性基因qSH1调节区序列进行测序分析。结果表明,161份供试品种在696个碱基序列上存在13个变异位点,归为6种DNA单倍型,在功能位点12 290上,仅H6为T,属不易落粒单倍型,其余单倍型均为G,属易落粒单倍型。贵州地方稻(包括贵州禾)出现了所有的6种单倍型,H5为优势单倍型,占85.48%,云南地方稻仅出现H2、H3、H5这3种单倍型,H3为优势单倍型,占62.49%,两省地方稻在基因型种类和优势单倍型上均存在差异。其余稻种(包括日韩品种)全归为H5、H6两种单倍型,中国北方省份80.95%品种归属单倍型H6,南方省份85.71%选育品种归于易落粒单倍型H5,南北方在优势单倍型上存在差异。49份贵州禾归为H1、H4、H5这3种单倍型,H1、H4仅在贵州禾中出现,H5为优势单倍型,占91.84%,贵州禾外的13份贵州地方水稻品种归为H2、H3、H5、H6这4种单倍型,H5是优势类型,占61.54%,贵州禾和贵州其他地方品种在基因型种类和优势单倍型频率上均存在差异。贵州禾q SH1基因型均属易落粒类型,不能解释其不易落粒的特性,推测qSH1另有调控机制或qSH1不是贵州禾落粒性的主要驯化位点。

  • 相关文献

[1]贵州地方稻种Wx基因序列多样性分析. 孙一丁,马继琼,杨奕,陈惠查,焦爱霞,谭金玉,阮仁超,许明辉. 2019

[2]Pikh,Pi2,Pi9,Pi5 4个稻瘟病抗性基因在贵州禾中的分布. 马继琼,孙一丁,杨奕,李进斌,陈惠查,焦爱霞,谭金玉,阮仁超,许明辉. 2018

[3]Pikh,Pi2,Pi9,Pi5 4个稻瘟病抗性基因在贵州禾中的分布. 马继琼,孙一丁,杨奕,李进斌,陈惠查,焦爱霞,谭金玉,阮仁超,许明辉. 2018

[4]滇龙胆GrWRKY5基因的克隆和植物表达载体构建. 王彩云,李富生,李涛,李彩霞,张晓东,王元忠. 2015

[5]元江普通野生稻金属硫蛋白(YJMT-2)的获得及序列分析. 史冬燕. 2009

[6]家蚕微孢子虫感染对家蚕海龟蛋白(Bmtutl)基因表达水平的影响. 朱峰,高建华,张永红,肖圣燕,邵榆岚,唐芬芬,白兴荣. 2019

[7]稻瘟病抗性基因Pita在中日韩粳稻中的分布. 马继琼,孙一丁,杨奕,李进斌,许明辉. 2020

[8]琥珀蚕胆绿素结合蛋白基因AaBP-1的克隆及表达分析. 李琼艳,陈安利,钟健,刘增虎,廖鹏飞,杨伟克,董占鹏. 2019

[9]番木瓜环斑病毒南瓜分离物外壳蛋白基因的克隆及序列分析. 杨国慧,张仲凯,崔崇士. 2007

[10]云南蔓草虫豆丛枝植原体rp基因序列分析及结构预测. 王柱华,杨子祥,苏帆,何孟兰,毛清源,万琼莲,王连春,蔡红. 2021

[11]由斯里兰卡入境的甘蔗茎腐病病原分离鉴定. 王晓燕,李庆红,张荣跃,单红丽,李婕,李银煳,黄应昆. 2023

[12]三七病原根结线虫核糖体基因ITS区段的克隆测序及其在检测中的应用. 杨佩文,冯光泉,董丽英,陈昱君,刘树芳,刘云芝,李家瑞,崔秀明. 2008

[13]茶组植物种间关系的cpDNA、rDNA ITS和mtDNA序列分析. 赵洋,杨培迪,成杨,刘本英,李游勇,杨阳. 2018

[14]茶树糖转运蛋白CsPLt基因的克隆与序列分析. 陈玫,夏丽飞,陈林波,蒋红旗,田易萍,包云秀,尚未琼. 2014

[15]云南花生丛枝植原体secY基因序列分析及结构预测. 万琼莲,蔡红,杨子祥,王连春,陈海如. 2013

[16]水杨酸诱导的烟草抗性相关序列的分离. 董霞,李文正,付坚,兰建强,李正风,刘世贵. 2007

[17]滇龙胆1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸还原异构酶基因GrDXR的克隆、序列分析与原核表达. 张晓东,赵静,李彩霞,李涛,王元忠. 2014

[18]国外引进甘蔗材料白叶病植原体巢式PCR检测及其序列分析. 王晓燕,李文凤,黄应昆,张荣跃,单红丽. 2016

[19]疣粒野生稻金属硫蛋白基因的获得及序列分析. 史冬燕,程在全. 2009

[20]滇龙胆GrGPPS基因的克隆及其序列分析与原核表达. 王彩云,李富生,李涛,李彩霞,张晓东,王元忠. 2014

作者其他论文 更多>>