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小麦条锈病菌EST序列中微卫星的频率和分布

文献类型： 中文期刊

作者： 刘林 1 ; 胡燕玲 1 ; 杨静 1 ; 张庆 2 ; 李进斌 2 ; 李成云 1 ;

作者机构： 1.云南农业大学

2.云南省农业科学院农业环境资源研究所

关键词： 小麦条锈病菌;表达序列标签;微卫星

期刊名称： 云南农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1004-390X

年卷期： 2011 年 26 卷 02 期

页码： 173-176

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 研究利用已公布的7 368条小麦条锈病菌表达序列标签(expressed sequence tags,EST)序列,对其EST序列中的微卫星(microsatellite)或简单重复序列(simple sequence repeats,SSRs)进行了系统分析。结果表明,在已公布的7 368条小麦条锈病菌EST序列中,共有2 642个SSR序列(长度大于15 bp,匹配值大于80%),相当于平均3条EST序列中分布有1个SSR序列。在这些SSR中,单碱基SSR最多,数量达2 320个,占SSR总数的87.8%;其次为三碱基SSR,数量为137个,约占SSR总数的5.2%;五碱基重复的SSR数量最少,为34个。且有的SSR的重复数较多,这将有利于小麦条锈病菌SSR分子标记的开发与应用。

  • 相关文献

[1]非洲菊ESTs-SSR标记的频率和分布特点. 王继华,瞿素萍,唐开学,李成云,陈海如. 2006

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