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蓖麻SnRK2基因家族的鉴定和特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 敖涛 1 ; 胡尊红 2 ; 和珊 3 ; 胡学礼 2 ; 刘旭云 2 ; 刘爱忠 1 ;

作者机构: 1.中国科学院西双版纳热带植物园热带植物资源开放实验室

2.云南省农业科学院经济作物研究所

3.中国科学院昆明植物研究所

关键词: 蓖麻;SnRK2;蛋白激酶;ABA;Na Cl;冷胁迫

期刊名称: 中国油料作物学报

ISSN: 1007-9084

年卷期: 2015 年 37 卷 02 期

页码: 160-166

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: SnRK2是一类植物特有的Ser/Thr类蛋白激酶。为研究其在蓖麻抗逆过程中的作用,基于蓖麻的基因组序列信息,利用生物信息学方法鉴定了6个蓖麻SnRK2蛋白激酶成员。分析发现这些蛋白具有亲水性属性,基因结构分析表明,植物SnRK2基因在进化过程中具有很高的保守性;系统与进化分析发现植物SnRK2蛋白在单、双子叶植物中分化显著,可能是独立演化的结果。高通量RNA-seq测序结果显示,大部分SnRK2基因在检测的各个组织中均有表达,且在不同组织间或种子发育的不同阶段没有明显的组织特异性;外源ABA处理种子后,Group 2的基因表达显著上调。进一步利用半定量RT-PCR技术检测外源(100μmol/L)ABA、(250mmol/L)Na Cl和(4℃)冷胁迫处理的幼苗,发现Group 2中的基因29908.m006067被这3种胁迫强烈激活,基因29772.m000313对ABA和冷胁迫有较强的响应。

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