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云南栽培稻种SSR遗传多样性比较

文献类型: 中文期刊

作者: 吕广磊 1 ; 蔺忠龙 2 ; 白现广 2 ; Kyung-Ho Ma 3 ; 付坚 2 ; 刘芳芳 4 ; 黄兴奇 2 ; Jae-Gyun Gway 3 ; 程在全 2 ;

作者机构: 1.云南农业大学农学与生物技术学院

2.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所

3.韩国农业生物技术遗传资源所

4.云南大学生命科学学院

关键词: 栽培稻;遗传多样性;选育品种;地方品种;SSR

期刊名称: 植物学报

ISSN: 1674-3466

年卷期: 2009 年 44 卷 04 期

页码: 457-463

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用64个SSR标记对96份云南水稻(Oryza sativa)地方品种和选育品种的遗传多样性进行比较分析。结果发现64个标记都具有多态性,共检测到741个等位基因,每个多态性位点检测到的等位基因数为2-29个,平均11.57个;Nei基因多样性指数(He)范围在0.345(RM321)-0.932(RM1)之间,平均为0.56。水稻品种的遗传多样性并非按地理位置均匀分布,而是在相似系数为0.17的水平上明显分为2个不同类群,即籼稻类群和粳稻类群,且籼粳亚种间的SSR多样性差异不明显,籼稻平均等位基因数(Ap)和Nei基因多样性指数(Ap=10.6,He=0.46)与粳稻品种(Ap=10.7,He=0.48)十分接近,可能与这些品种间存在一定频率的基因交流有关。糯稻和非糯稻在籼稻群和粳稻群中都有表现,没有特别的分布规律。云南栽培稻选育品种与地方稻亲缘关系较近,其遗传基础可能来源于云南水稻地方品种。本研究结果表明,SSR标记能较好地区分云南栽培稻品种,且云南水稻地方品种遗传多样性丰富,存在大量的优质性状可供育种实践选择。

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