您好,欢迎访问云南省农业科学院 机构知识库!

小麦条锈菌看家基因SNP引物的开发及多态性位点研究

文献类型: 中文期刊

作者: 李明菊 1 ; Md.Ashraful Alam 2 ; 李昊星 2 ; 程加省 2 ; 丁明亮 3 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院农业环境资源研究所;孟加拉国农业研究所小麦研究中心;华中农业大学生命科学技术学院;云南省农业科学院粮食作物研究所

2.;云南省农业科学院农业环境资源研究所;孟加拉国农业研究所小麦研究中心;华中农业大学生命科学技术学院;云南省农业科学院粮食作物研究所

3.;云南省农业科学院农业环境资源研究所;孟加拉国农业研究所小麦研究中心;华中农业大学生命科学技术学院;云南省农业科学院粮食作物研究所;

关键词: 小麦条锈菌;看家基因;单核苷酸序列多态性;引物开发

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2018 年 05 期

页码: 1539-1544

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用NCBI数据库进行小麦条锈菌看家基因SNP引物开发,从NCBI搜索到15个基因的序列,利用Primer Premier 5.0软件设计了22对引物,利用其进行条锈菌DNA的PCR扩增、测序,并与标准序列比对,从而筛选出SNP引物。在候选基因中,柠檬酸盐合酶(Cs)、热休克蛋白hsp90(Hsp)、泛素活化酶E1(Uba)及泛素结合酶E2(Ubc)4个基因的5对SNP引物表现多态性,能检测到条锈菌SNP位点依次为4、6~7、4和7个,均为系统发生信息位点,并摸索出优化的PCR反应体系及条件。利用开发的引物研究条锈菌群体结构,可揭示病原菌起源、进化、传播,为病害治理提供依据。

  • 相关文献

[1]基于紫娟茶叶片转录组的SSR引物开发. 周萌,宋维希,鄢文光,李晓霞,陈继伟,夏丽飞,梁家斌,陈林波. 2016

[2]小麦条锈菌DNA微量高效提取及AFLP检测. 刘太国,陈万权,高利,周益林,段霞瑜. 2010

[3]小麦条锈菌DNA微量高效提取及AFLP检测. 刘太国,陈万权,高利,周益林,段霞瑜. 2010

[4]云南省小麦条锈菌生理小种组成与分布研究. 李明菊,邬琰,吕建平,范静华,朱有勇. 2005

[5]不同栽培模式对小麦条锈菌群体结构的影响. 李进斌,兰茗清,杨进成,陈向东,李月秋,朱有勇,李成云. 2014

作者其他论文 更多>>