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疣粒野生稻应答黄单胞杆菌水稻致病变种(Xoo)的基因芯片

文献类型： 中文期刊

作者： 罗玉 1 ; 陈善娜 2 ; 伍文婷 2 ; 吕广磊 2 ; 蒋春苗 2 ; 程在全 2 ;

作者机构： 1.昆明学院生命科学与技术系

2.昆明学院生命科学与技术系;云南大学生命科学院;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所

关键词： 芯片制备;疣粒野生稻;微阵列;基因表达;黄单胞杆菌水稻致病变种

期刊名称： 植物生理学报

ISSN： 2095-1108

年卷期： 2012 年 08 期

页码： 821-827

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 探讨疣粒野生稻应答黄单胞杆菌水稻致病变种(Xoo)的基因芯片制作,通过芯片杂交筛选抗病相关基因。芯片含有2436个片段,来自于应答Xoo的疣粒野生稻差减文库和cDNA文库,通过芯片杂交及微阵列分析基因表达,选其中800个样品点测序比对。其中,35个无同源序列,大部分有同源序列的功能未知,已知功能的序列中明显上调表达的基因有:富含脯氨酸蛋白、泛素连接酶、伸展蛋白、谷胱甘肽S-转移酶II、脂类转移酶等,明显下调表达的基因有:细胞色素P450单加氧酶、醛缩酶、金属硫蛋白、硫氧还蛋白、热激蛋白等,表达无明显变化的基因有:抗坏血酸过氧化物酶、转铜伴侣、脂酶、花丝温敏H2A蛋白等。高通量基因芯片的利用及微阵列分析是筛选抗病相关基因、获取大量抗病相关信息的有效手段。

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