您好,欢迎访问云南省农业科学院 机构知识库!

云南小驳骨丛枝植原体的分子鉴定及相关基因序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 许杏萍 1 ; 苏帆 1 ; 杨子祥 2 ; 刘俊男 1 ; 万琼莲 3 ; 蔡红 1 ;

作者机构: 1.云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室

2.云南省农业科学院热区生态农业研究所

3.玉溪师范学院化学生物与环境学院

关键词: 小驳骨丛枝病;植原体;16S rRNA基因;rp基因;secY基因;secY蛋白

期刊名称: 云南农业大学学报(自然科学版)

ISSN:

年卷期: 2021 年 002 期

页码: 205-214

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】确定采自元谋地区自然表现丛枝病的小驳骨(Gendarussa vulgaris Nees)植株是否感染植原体。【方法】通过利用植原体16S组和亚组通用或半通用特异性引物分别对植原体16S rRNA、rp和secY基因序列进行PCR扩增、克隆及测序分析;此外还对secY蛋白的蛋白特性及其结构进行了分析和预测。【结果】本研究获得了基因片段长度分别为1 248 bp的16S rRNA基因(nested PCR)、1 171 bp的rp基因和1 425 bp的secY基因。基于rp和secY基因核苷酸序列的同源性比对及构建的进化树推断的植原体遗传分化关系几乎与16S rRNA基因的推断相一致,均与植原体16S rⅡ-A亚组各株系的遗传进化关系最为接近,但rp和secY基因序列比16S rRNA基因序列能够呈现出更大的遗传变异程度;此外,对secY蛋白进行了生物信息学分析和初步探讨,发现它具有10个明显且分布相对均匀的跨膜螺旋区域,无信号肽。【结论】小驳骨丛枝病(Gendarussa vulgaris witches’-broom phytoplasma,GvWB-YNym)是由植原体侵染而发生,该植原体株系被划分到16S rⅡ-A亚组,相关的候选种为Candidatus Phytoplasma aurantifolia;secY蛋白生物信息参数的分析表明:secY蛋白在感病小驳骨植株中以疏水性稳定跨膜蛋白的形式存在,含10个明显的疏水跨膜区域,该蛋白不存在信号肽。

  • 相关文献

[1]云南芝麻丛枝和花变叶植原体16S rRNA和rp基因序列分析. 苏帆,杨子祥,王柱华,万琼莲,何孟兰,毛清源,蔡红. 2021

[2]云南蔓草虫豆丛枝植原体16S rDNA和secY基因序列分析. 王柱华,刘俊男,杨子祥,赵宇,蔡红,陈海如. 2018

[3]云南花生丛枝植原体secY基因序列分析及结构预测. 万琼莲,蔡红,杨子祥,王连春,陈海如. 2013

[4]云南蔓草虫豆丛枝植原体rp基因序列分析及结构预测. 王柱华,杨子祥,苏帆,何孟兰,毛清源,万琼莲,王连春,蔡红. 2021

[5]云南保山蔗区首次检测发现检疫性病害甘蔗白叶病植原体. Huang Ying-kun,黄应昆,李文凤,Li Wen-feng. 2014

[6]我国植物支原体类病害的种类. 蒯元璋,张仲凯,陈海如. 2000

[7]温水处理对甘蔗白叶病植原体的脱除效果研究. 单红丽,李文凤,黄应昆,王哓燕,张荣跃,罗志明,申科,尹炯. 2013

[8]黄槐丛枝病植原体的检测及鉴定. 蔡红,李小林,孔宝华,陈海如. 2005

[9]组培法保存花椰菜丛枝植原体的初步研究. 万琼莲,木万福,张茹岚,王连春,蔡红. 2016

[10]云南西盟蔗区发现检疫性病害甘蔗白叶病. 张荣跃,李文凤,黄应昆,王晓燕,单红丽,李婕,仓晓燕,罗志明,尹炯. 2019

[11]耿马甘蔗白叶病植原体昆虫介体调查与检测. 李文凤,王晓燕,仓晓燕,张荣跃,单红丽,卢文洁,王长秘,尹炯,黄应昆. 2022

[12]云南花生丛枝植原体16S rRNA和核糖体蛋白基因序列分析. 万琼莲,杨子祥,王连春,蔡红,陈海如. 2014

[13]甘蔗白叶病植原体PCR检测方法的建立与应用. 张荣跃,马永德,李婕,王晓燕,单红丽,李银煳,黄应昆. 2023

作者其他论文 更多>>