基于RNA-Seq技术的茶树花转录组分析

夏丽飞; 朱兴正; 梁名志; 马伟; 宋维希; 田易萍; 周萌; 陈林波; 《西南农业学报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：本研究利用RNA-seq技术对父本、母本、子代不育茶树花三个样本花的转录组进行测定,经组装分析获得403 469条高质量的Unigenes。将获得的Unigenes与SWISS-PROT、TREMBL、CDD、PFAM、NR和KOG库进行blast,共注释到307 291条Unigenes。KOG功能分类显示,有23 739个Unigenes被分为25类。KEGG通路分析表明,共识别出26 967个Unigenes涉及的pathway有328个。SSR查找发现,从403 469个Unigenes中找到46 440个含有SSR序列。这些信息为茶树不育基因筛选、不育机理研究以及分子标记开发奠定了基础。

关键词： 茶树 转录组测序 不育基因 分子标记

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