科研产出
云南烟草产区辣椒脉斑驳病毒的调查及其遗传多样性分析
《植物保护 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：明确辣椒脉斑驳病毒(chilli veinal mottle virus,ChiVMV)在云南6个州(市)烟草生产区的分布、遗传多样性和群体遗传结构,对病害的防控预警具有重要意义.本研究以2022年采集自云南6个州(市)不同烟草产区的96份疑似感染ChiVMV的烟草样品为试验材料,利用电子显微镜负染色观察和分子生物学方法对病毒进行检测和鉴定,获得21个ChiVMV云南烟草分离物的 cp基因序列.利用SDT、MEGA、RDP、DnaSP及Arlequin等生物学软件对21个云南烟草分离物及NCBI上下载的38个来自不同国家、地区及寄主的ChiVMV分离物cp基因序列的系统进化、遗传多样性和群体遗传结构特征进行分析.结果显示,从云南6个州(市)烟草生产区采集的96份烟草样品中,ChiVMV检出率为51.04%;序列比对发现,本研究获得的cp基因与NCBI中38个ChiVMV分离物cp基因的核苷酸一致性在84.1%以上;系统发育分析发现,59个ChiVMV分离物按照地理位置的远近被划分为4个分支,聚类结果具有明显的地理分布特征,而与寄主植物无关;遗传多样性和遗传分化分析表明,4个地理种群的ChiVMV cp基因遗传多样性水平均较高,中国种群与印度、泰国和其他国家种群间发生了很大的遗传分化且差异显著(P<0.05);遗传力分析显示,基因交流、遗传漂变和基因的负选择压力是ChiVMV分离物适应性进化的重要方式.
关键词： 辣椒脉斑驳病毒 云南 遗传多样性 遗传结构 cp基因
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侵染假酸浆的泰国番茄黄化曲叶病毒全基因组结构特征
《植物保护 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为明确假酸浆Nicandra physalodes叶片黄化、皱缩症状是否由菜豆金色花叶病毒属病毒侵染引起，本研究利用分子检测方法和生物信息学技术鉴定了假酸浆样品中的病毒种类。从采集的病样中克隆并获得了2条菜豆金色花叶病毒属病毒DNA-A全序列和1条beta卫星全序列，经全序列分析发现，该双生病毒的两条DNA-A全序列与泰国番茄黄化曲叶病毒（tomato yellow leaf curl Thailand virus, TYLCTHV）云南分离物TYLCTHV-YN1732一致性最高，达99.3%,亲缘关系较近；beta卫星的全序列与云南番茄曲叶beta卫星（tomato leaf curl Yunnan betasatellite, TLCYnB）的分离物YN5230一致性最高，达99.3%,亲缘关系较近。重组分析显示，假酸浆上分离的TYLCTHV-YN5735-12是一个重组病毒，有两个重组事件，一个主要发生在AV1的编码区，由中国番茄黄化曲叶病毒（tomato yellow leaf curl China virus, TYLCCNV）和广西大戟曲叶病毒（euphorbia leaf curl Guangxi virus, EuLCGXV）重组形成，另一个重组事件主要发生在基因间隔区（IR区）,由泰国烟草卷叶病毒（tobacco leaf curl Thailand virus, TbLCTHV）和TYLCTHV重组形成。研究结果表明，假酸浆是TYLCTHV的新寄主，这是单组分菜豆金色花叶病毒属病毒及其伴随beta卫星侵染假酸浆的首次报道。
关键词： 假酸浆 泰国番茄黄化曲叶病毒 基因组特征 重组
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侵染云南雾水葛的菜豆金色花叶病毒属病毒的全基因组结构特征
《植物病理学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：为明确云南雾水葛表现叶片黄化、花叶等症状的植株是否被菜豆金色黄花叶病毒属病毒侵染，本研究通过PCR扩增、克隆测序及核苷酸序列特征分析，确定样品中病原种类及其系统进化关系。结果显示，该病样中检测到雾水葛金色花叶病毒（pouzolzia golden mosaic virus, PouGMV）,该分离物全基因组具有典型的菜豆金色花叶病毒属单组分病毒结构特征，与来自越南的Vietam分离物（KC857508）亲缘关系最近，相似性最高达94.6%,与PouGMV其他分离物亲缘关系相对较远，相似性在88.9%～93.2%之间。病毒alpha卫星分子检测及分析显示，该样品中检测到的alpha卫星分子，其全长核苷酸序列与云南番茄黄化曲叶alpha卫星（tomato yellow leaf curl Yunnan alphasatellite, TYLCYnA）相似性最高，达到92.3%。研究结果表明云南雾水葛中分离到PouGMV,且异源伴随TYLCYnA卫星分子。这是雾水葛金色花叶病毒伴随alpha卫星分子侵染雾水葛的首次报道。
关键词： 雾水葛 雾水葛金色花叶病毒 Alpha卫星分子 基因组结构
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侵染凤仙花的菜豆金色花叶病毒的鉴定及基因组结构分析
《园艺学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：在对云南省西双版纳州进行病毒病害调查时发现1株疑似菜豆金色花叶病毒属病毒侵染的凤仙花植株,其症状表现为叶片皱缩和花叶.利用菜豆金色花叶病毒属病毒简并引物进行PCR扩增、克隆和分析,获得YN6198-28和YN6198-31两条菜豆金色花叶病毒属病毒的DNA-A全长序列,长度均为2 763 bp,编码6个开放阅读框,其中YN6198-28核苷酸序列与越南丁香黄脉病毒(Ludwigia yellow vein Vietnam virus,LuYVVNV)相似性为94.90%,表明该分离物是LuYVVNV1个分离物.重组分析发现,YN6198-28是种间重组病毒,其主要亲本为丁香黄脉病毒(Ludwigia yellow vein virus,LuYVV),次要亲本为中国胜红蓟黄脉病毒(Ageratum yellow vein China virus,AYVCNV).
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侵染青蒿的烟草曲茎病毒的分子鉴定及基因组结构特征分析
《植物保护 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：菜豆金色花叶病毒属病毒是一类在全球热带及亚热带地区造成严重经济损失的植物病毒,田间杂草是这类病毒重要的中间寄主。本研究从云南省玉溪市采集了表现黄脉的青蒿植株,通过PCR扩增、克隆及测序从样品中获得两条菜豆金色花叶病毒属病毒DNA-A全基因组序列,分别为YN6393-23和YN6393-27,其全长均为2 739 bp,相似性为100%。序列分析发现,YN6393-23和YN6393-27的核苷酸序列与烟草曲茎病毒Tobacco curly shoot virus（TbCSV）的分离物YN4584的核苷酸序列相似性最高,为99.45%。根据国际病毒分类委员会对菜豆金色花叶病毒属病毒种的分类标准,全基因组序列相似性大于91%则为同种病毒,表明此病毒分离物为烟草曲茎病毒的一个分离物。这是菜豆金色花叶病毒属病毒侵染青蒿植株的首次报道。
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一种侵染鳢肠的双生病毒基因组特征
《植物病理学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：菜豆金色花叶病毒属病毒是热带及亚热带地区经济作物的重要病原病毒,该类病毒在田间的杂草寄主范围较为广泛。本研究从云南红河流域采集到叶脉黄化的鳢肠植株,经克隆获得了菜豆金色花叶病毒属病毒分离物YN3306,该分离物核苷酸序列全长2749 nt,具有典型的双生病毒基因组结构特征。进一步分析发现,分离物属于金腰剑曲叶病毒(Synedrella leaf curl virus,SyLCV),RDP软件分析表明,该分离物是由烟草曲茎病毒(Tobacco curly shoot virus,Tb CSV)、云南烟草曲叶病毒(Tobacco leaf curl Yunnan virus,TbLCYnV)和金腰剑曲叶病毒重组产生的病毒。本研究首次报道了GenBank中在印度注册的SyLCV可以侵染鳢肠植株。
关键词： 鳢肠 菜豆金色花叶病毒属病毒 基因组 重组
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侵染苣荬菜的中国胜红蓟黄脉病毒及伴随的卫星基因组结构特征
《植物保护 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：杂草是菜豆金色花叶病毒属病毒的重要中间寄主,常富集多种该属病毒及其卫星病毒。2014年,在云南红河常见杂草苣荬菜Sonchus arvensis上出现了疑似菜豆金色花叶病毒属病毒病症状。利用克隆、测序和生物信息学分析技术对其所含病毒进行分离鉴定,结果从1株病样中共获得了两条菜豆金色花叶病毒属病毒全序列、两条β卫星全序列和一条α卫星全序列。序列分析显示,两条菜豆金色花叶病毒属病毒全序列与中国胜红蓟黄脉病毒相似性最高,分别为99%和96%,确定为中国胜红蓟黄脉病毒的分离物。两条β卫星全序列与赛葵黄脉β卫星相似性最高,为97%,确定为赛葵黄脉β卫星的一个分离物。α卫星全序列与中国番茄黄化曲叶α卫星相似性最高,为86.3%,是中国番茄黄化曲叶α卫星的一个分离物。这是菜豆金色花叶病毒属病毒病害复合体在中国侵染苣荬菜的首次报道。
关键词： 菜豆金色花叶病毒属病毒 α卫星 β卫星 苣荬菜
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