科研产出
云南芝麻丛枝和花变叶植原体16S rRNA和rp基因序列分析
《植物病理学报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：本研究通过对表现出丛枝和花变叶症状的芝麻感病植株总DNA进行植原体16S rRNA和rp基因的PCR扩增、克隆、测序及序列分析,明确了两种病株的病原均为植原体,并将其命名为云南元谋芝麻丛枝植原体（SEWB-YNym）和云南元谋芝麻花变叶植原体（SEP-YNym）。两个株系的16S rRNA基因片段长度均为1 248 bp,并且碱基序列完全一致。通过与其他地区报道的芝麻植原体株系16S rRNA基因序列比对后发现这两个株系与来自缅甸的株系不存在位点差异,而与泰国、中国台湾、印度的株系分别存在3～6个位点差异。同时,还从两个株系中获得了长度均为1 171 bp并且碱基序列也完全一致的SEWB-YNym和SEP-YNym的rp基因序列。此rp基因序列包括全部rpl22基因（nt90-476）和部分rps3基因（nt550-1170）,分别编码128和206个氨基酸。通过对16S rRNA和rp基因的序列进行同源性比对、构建系统进化树等分析,表明两个株系与候选种‘Candidatus Phytoplasma aurantifolia’相关,为16SrII-A亚组成员,并归属于植原体rp-iii亚进化支。
关键词： 芝麻 丛枝 花变叶 植原体 16S rRNA基因 rp基因
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黄槐丛枝病植原体的检测及鉴定
《植物病理学报 》 2005 北大核心 CSCD
摘要：应用植原体 16SrRNA基因通用引物,对自然表现丛枝的黄槐植株进行巢式PCR检测,得到约 1 2kb的特异片段,证明此植株中存在植原体。将此特异片段与pGEM TEasy载体连接并转化到大肠杆菌JM109感受态细胞中,通过PCR鉴定、序列测定及同源性比较分析,结果表明此植原体株系(STWB)16SrDNA片段G+C含量为 45 8%,与榆树黄化植原体组(Elmyellowsgroup, 16SrVgroup)中的各株系最高同源率可达 99 4%,而与其它组中的株系明显低于 97 0%,故认为该植原体株系为榆树黄化植原体组中的成员之一。
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