苦荞FtERF基因克隆、生物信息学及其表达分析

张俊; 蔡苏云; 徐子豪; 侯蕾; 贺润丽; 尹桂芳; 王莉花; 王艳青; 卢文洁; 孙道旺; 《作物杂志 》 2024 北大核心 CSCD

摘要：乙烯响应因子对植物发育和细胞代谢具有重要作用.通过RT-PCR从苦荞中克隆出ERF基因,对其进行生物信息学分析和差异表达分析.结果表明,FtERF基因开放阅读框长度为729bp,编码了 243个氨基酸,编码的蛋白分子量26.08kD,等电点9.22,属于亲水性蛋白.FtERF不含有信号肽和跨膜螺旋结构,亚细胞定位在细胞核内,蛋白质二级结构和三级结构高度相似.FtERF含有抑制基序DLNxxP,系统进化表明FtERF和ERF4关系较近.经荧光定量表达发现,厚壳苦荞不同部位表达均高于薄壳苦荞,苦荞发育成熟期表达高于非成熟期.

关键词： 苦荞 乙烯响应因子 生物信息学 表达分析