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苦荞FtERF基因克隆、生物信息学及其表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张俊 1 ; 蔡苏云 1 ; 徐子豪 1 ; 侯蕾 1 ; 贺润丽 1 ; 尹桂芳 1 ; 王莉花 1 ; 王艳青 1 ; 卢文洁 1 ; 孙道旺 1 ;

作者机构： 1.山西中医药大学中药与食品工程学院;云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业农村部西南作物基因资源与种质创制重点实验室

关键词： 苦荞;乙烯响应因子;生物信息学;表达分析

期刊名称： 作物杂志

ISSN： 1001-7283

年卷期： 2024 年 002 期

页码： 23-29

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 乙烯响应因子对植物发育和细胞代谢具有重要作用.通过RT-PCR从苦荞中克隆出ERF基因,对其进行生物信息学分析和差异表达分析.结果表明,FtERF基因开放阅读框长度为729bp,编码了 243个氨基酸,编码的蛋白分子量26.08kD,等电点9.22,属于亲水性蛋白.FtERF不含有信号肽和跨膜螺旋结构,亚细胞定位在细胞核内,蛋白质二级结构和三级结构高度相似.FtERF含有抑制基序DLNxxP,系统进化表明FtERF和ERF4关系较近.经荧光定量表达发现,厚壳苦荞不同部位表达均高于薄壳苦荞,苦荞发育成熟期表达高于非成熟期.

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