科研产出
甘蔗3个育种性状与SSR标记的关联分析及优异等位变异发掘
《作物学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：株高、茎径和锤度是甘蔗产量和蔗糖分两大育种目标的主要构成因子,鉴定与其相关的分子标记、发掘优异等位变异及典型载体材料,可为甘蔗分子标记辅助育种提供依据。本试验以62份甘蔗种质资源为材料,于成熟期调查4个种植环境条件下甘蔗株高、茎径和锤度3个育种性状,对表型数据进行方差和遗传变异分析,并基于37对SSR标记的分子数据,利用MLM方法进行关联分析,鉴定出优异关联标记并进行表型效应解析,发掘优异等位变异及载体材料。结果表明,基因型、种植环境及其两者互作对株高、茎径和锤度具有极显着影响。3个性状的广义遗传力范围为0.68～0.76,说明具有较稳定的遗传特性,其表现型主要由基因型决定。表型数据统计分析表明, 3个性状均呈现出数量性状的正态分布特征,变异系数范围为6.73%～19.89%,具有较丰富的表型变异。37对SSR引物共检测到204个等位变异,平均每对扩增到5.5135个,基因多样性平均值为0.6779,PIC平均值为0.6252,高度多态性标记（PIC＞0.5）占总量的89.19%。群体结构分析表明该群体可分为3个亚群。基于MLM模型,共检测到与株高、茎径和锤度相关的标记20个,表型变异解释率为5.04%～27.98%。其中7个标记在2个及以上环境中均检测到认为是优异关联标记,经表型效应解析共鉴定出8个具有增效效应的优异等位变异及携带优异等位变异的典型载体材料10份。该研究结果对甘蔗产量和糖分性状候选基因挖掘和杂交组合亲本选配具有重要指导意义。
关键词： 甘蔗 育种性状 SSR 关联分析 优异等位变异 等位变异效应
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关联分析及其在水稻遗传研究中的应用
《云南农业大学学报(自然科学) 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：近年来,以连锁不平衡为理论基础的关联分析被越来越广泛地应用于解析植物的数量性状,以发掘优异等位基因。本文阐述了关联分析的理论基础连锁不平衡及其影响因素和关联分析的分析策略及统计方法等,并将其与传统的基于连锁分析的QTL作图进行了比较分析,综述了其在水稻营养品质、形态与农艺性状、抗逆和抗病虫性等研究中的应用并对其今后的发展进行了展望。
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白菜类作物氮利用效率的关联分析
《中国蔬菜 》 2011 北大核心
摘要：为了研究白菜类作物氮利用效率遗传机制,定位与氮利用效率紧密相关的标记位点,利用分布于白菜全基因组的207个InDel标记,对160份有代表性的白菜类作物自然群体的基因组变异进行扫描,采用混合模型分析该群体的遗传结构,并应用TASSEL软件的GLM(General Linear Model)程序对叶片形态、植株形态和生物量相关的10个性状分别在两个氮处理水平进行关联分析。结果表明:InDel数据遗传结构分析将160个单株分为5个亚群体。关联分析结果表明:云南和北京的试验分别检测出45个和35个显著性相关标记,其中4个标记为两年共定位,平均贡献率为0.06。值得注意的是,关联到86个显著性变异位点只在一个氮水平被检测到,可能是氮处理水平的变化影响了某些相关基因的表达调控。
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