科研产出
基于流式细胞术对不同倍性草莓基因组大小的测定
《中国南方果树 》 2024 北大核心
摘要：以不同倍性草莓资源的嫩叶为材料，根据待测样品倍性预估基因组大小后分别选择水稻“日本晴”(基因组大小为430 Mb)、番茄(基因组大小为900 Mb)、玉米“B73”(基因组大小为2.3 Gb)作为内参，利用流式细胞仪测定样品的基因组大小。结果表明，二倍体资源，森林草莓基因组大小为(233±0.78) Mb,绿色草莓为(234±0.82) Mb;四倍体资源，西南草莓基因组大小为(492±2.12) Mb,伞房草莓(雄株)为(488±7.07) Mb,伞房草莓(雌株)为(491±4.95) Mb,伞房草莓雄株和雌株基因组大小均为首次测定；六倍体资源，麝香草莓基因组大小为(644±1.73) Mb;八倍体资源，栽培品种“章姬”基因组大小为(793±7.78) Mb,“蒙特瑞”为(761±0.00) Mb;十倍体资源，野生的择捉草莓基因组大小为(938±6.36) Mb,栽培品种“桃熏”为(1 007±6.36) Mb。
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云南4种野生猕猴桃基因组大小测定与比较
《中国南方果树 》 2022 北大核心
摘要：以云南野生美味猕猴桃（20DHD-3）、中华猕猴桃（20XSD-13）、京梨猕猴桃（20LHDZ-5）及显脉猕猴桃（20CJ-14）资源的嫩叶为材料，选用1种常用的细胞解离液（mGb）,利用基因组大小已知的番茄（Solanum lycopersicum）和玉米（Zea mays） B73为内参，以中华猕猴桃栽培品种红阳为对照，对4种野生猕猴桃的基因组大小进行了测定和比较分析。结果表明，美味猕猴桃、中华猕猴桃、京梨猕猴桃、显脉猕猴桃4个野生资源和中华猕猴桃栽培品种红阳的基因组大小（1 C值）分别为1.92、1.89、1.49、0.70和0.65 pg,两两间差异显著。
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流式细胞术测定5种苔藓植物的基因组大小
《分子植物育种 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：作为藻类和维管植物之间的过渡类群,苔藓植物不仅占有重要的进化地位,它同时可作为园艺上的观赏植物。目前对很多苔藓植物的培养条件、基因组大小等信息非常缺乏,且已进行基因组测序的苔藓物种较少,这些都严重制约了苔藓植物系统学的研究和资源利用。本研究以基因组大小为942 Mb的野生番茄（Solanum pennellii）为内标,采用流式细胞术对5种苔藓植物的基因组大小进行测定,结果表明,拟短月藓（Brachymeniopsis gymnostoma）的基因组大小约为391.40 Mb,绒叶青藓（Brachythecium velutinum）的基因组大小约为386.96 Mb,尖叶梨蒴藓（Entosthodon wichurae）的基因组大小约为441.01 Mb,桧叶白发藓（Leucobryum juniperoideum）的基因组大小约为493.21 Mb,明叶藓（Vesicularia montagnei）的基因组大小约为337.94 Mb。本研究为苔藓植物的全基因组测序、分子生物学研究、亲缘进化研究以及园艺苔藓品种开发和育种等方面提供重要信息。
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木本高山花卉马缨杜鹃的全基因组扫描分析
《基因组学与应用生物学 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：本研究采用高通量测序技术(Illumina Hiseq ~(TM)2000)首次对世界名贵园林花卉马缨杜鹃(Rhododendron delavayi)进行了基因组大小的测定,并评估了马缨杜鹃的GC含量、杂合率和序列重复度等信息参数,为马缨杜鹃全基因组测序策略的选择提供了有据参考。全基因组扫描结果如下:马缨杜鹃的基因组大小约为698 Mb,杂合率较高约为1.25%,GC含量约为39%,且具有一定的基因组序列重复度。研究表明:马缨杜鹃的全基因组测序分析不宜采用全基因组鸟枪法(WGS),可尝试WGS与fosmid或BAC-to-BAC相结合的测序策略,亦或采用杂合组装软件进行序列拼装,以提高全基因组序列的拼装质量。
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34种秋海棠基因组大小比较与分析
《植物遗传资源学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：以34种野生秋海棠(包括4个变种)为试材,水稻(Oryza sativa L.subsp.japonica Kato)为外标,采用流式细胞法测定其基因组大小,比较不同种、组之间基因组大小的差异,并分析与染色体数的相关性。结果表明:34种秋海棠基因组大小在0.292~2.554 pg之间,最大值约为最小值的9倍,平均基因组大小为0.863 pg,最小的为盾叶秋海棠(Begonia peltatifolia H.L.Li),最大的为水鸭脚秋海棠(B.formosana(Hayata)Masam.)。中国原产的30种秋海棠平均基因组大小(1C=0.925 pg)较南美洲原产的4种的(1C=0.398 pg)大,中国台湾原产的3种秋海棠基因组均比大陆原产的27种的大。中国原产秋海棠不同组间基因组的大小存在差异,同一组内基因组大小亦不相同,本研究所测材料以四室组的基因组最大,为1.285 pg,组内变化近3.2倍;秋海棠组和二室组次之,分别为0.895 pg和0.888 pg,组内变化近6.4、6.8倍;侧膜胎座组基因组最小,为0.721 pg,组内变化约1.2倍。相关性分析表明秋海棠基因组大小与染色体数无显著相关性。本结果可为秋海棠遗传多样性分析及基因组学研究提供一定的基础数据。
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