西方蜜蜂囊状幼虫病病毒云南毒株的多聚蛋白基因扩增及序列分析

曹兰; 沈克飞; 王瑞生; 张邑帆; 高丽娇; 张祖芸; 曹联飞; 《中国生物制品学杂志 》 2021 CSCD

摘要：目的扩增云南地区西方蜜蜂（Apis mellifera）自然感染囊状幼虫病病毒（sacbrood virus,SBV）的多聚蛋白（polyprotein）基因,并进行序列分析。方法采用RT-PCR方法分别从云南3份感染SBV的西方蜜蜂幼虫样本中扩增SBV的多聚蛋白基因,进行序列测定、拼接、序列比对、基因重组及分子进化分析。结果通过序列拼接得到3条云南西方蜜蜂的SBV（AmSBV-YN）序列,占SBV基因组长度的97%,包含完整的多聚蛋白基因。3条AmSBV-YN序列间的同源性大于99%,与GenBank上已知SBV序列的同源性为91%～93%。AmSBV-YN与韩国西方蜜蜂的SBV（AmSBV-Kor）_KP296800可能在5′端发生重组。多聚蛋白基因构建的进化树显示,AmSBV-YN单独构成云南基因型,在RNA依赖的RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase,RdRp）基因进化树中显示,AmSBV-YN与其他感染中国西方蜜蜂的SBV（AmSBV-Chn）聚集成云南基因型。结论成功扩增出SBV云南毒株的多聚蛋白基AmSBV-YN,SBV具有丰富的遗传多样性,AmSBV-YN可能是感染我国西方蜜蜂SBV的代表株。

关键词： 蜜蜂 囊状幼虫病病毒 多聚蛋白基因 同源性 进化树