云南大花蕙兰复合感染的ORSV和CyCMV病毒基因组序列特征分析

金晓香; 姚俊汐; 尹跃艳; 李婷婷; 郭淼; 钟静; 和寿星; 陈越; 和家卫; 鄢波; 丁铭; 《园艺学报 》 2024 北大核心 CSCD

摘要：从云南丽江采集了40个大花蕙兰（Cymbidium hybridum）感病样品，利用高通量转录组测序对其中的病毒种类进行分析，Blastn N比对发现样品中存在建兰花叶病毒（cymbidium mosaic virus,Cym MV）、齿兰环斑病毒（odontoglossum ringspot virus,ORSV）和建兰褪绿花叶病毒（cymbidium chlorotic mosaic virus,Cy CMV）。利用RT-PCR对样品中病毒分离物的CP序列进行扩增，10份样品为ORSV和Cy CMV复合侵染。为进一步明确ORSV和Cy CMV云南分离物（ORSV-DH和Cy CMV-DH）的序列特征，分别对其全基因组序列进行了扩增及克隆，结果表明：ORSV-DH基因组全长序列为6 611 nt(Accession No.OP644547),Cy CMV-DH基因组全长序列为4 083 nt(Accession NO.OP629812），将ORSV-DH和Cy CMV-DH分别与已报道的分离物的全基因组序列进行核苷酸序列分析，发现ORSV-DH与其他分离物的核苷酸相似性为97.69%～99.41%,Cy CMV-DH为89.84%～98.19%。根据病毒全基因组核苷酸序列分别构建了ORSV-DH和Cy CMV-DH与本属其他分离物的系统进化树，明确了其分别与日本分离物ORSV-Cy-1(S83257）、Cy CMV-Japan(NC＿027123）亲缘关系最近。

关键词： 大花蕙兰 齿兰环斑病毒 建兰褪绿花叶病毒 基因组序列特征 复合侵染