盐胁迫条件下不同基因型籼稻表达谱芯片数据分析

刘慰华; 吕宏斌; 钱敏; 黄格; 郑爱清; 崔永祯; 赵红; 朱振华; 丁明亮; 《分子植物育种 》 2019 北大核心 CSCD

摘要：盐胁迫是制约水稻产量的主要逆境因素之一,特别是对幼穗分化期的水稻产量影响尤其显著.本研究以水稻Affymetrix表达谱芯片的数据为例,应用生物信息学方法进行数据挖掘,研究幼穗分化期籼稻耐盐品种FL478和感盐品种IR29在盐胁迫处理条件下的基因差异表达情况.芯片数据分析共筛选到差异倍数在2倍及以上的基因257个,以IR29为参照,FL478中上调基因138个,下调基因119个,主要涉及到β-丙氨酸生物合成、木糖降解、脂肪酸β氧化等生物学过程.通过这些数据挖掘,初步探讨籼稻抗盐胁迫的表达调控机理.本研究为进一步揭示籼稻耐盐性分子机制提供了科学依据.

关键词： 盐胁迫 基因芯片 数据挖掘