基于系谱和SSR标记的高山杜鹃杂交种亲缘关系分析

张露; 王继华; 解玮佳; 蔡艳飞; 宋杰; 彭绿春; 李树发; 李世峰; 《西北植物学报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：该研究对高山杜鹃(Rhododendron L.)的总DNA提取方法进行了改良,然后综合利用高山杜鹃EST数据库和该实验室的马缨杜鹃高通量测序数据,引用已发表文献的SSR引物,从154对SSR引物中筛选出了26对多态性高、重复性好、条带清晰的SSR引物。再从中随机选择10对SSR引物进行荧光标记,对69份不同高山杜鹃的种质进行遗传多样性分析。结果表明,平均有效等位基因数6.959 2个;位点多态性信息含量(PIC)、观测杂合度(HO)、期望杂合度(HE)和Neis基因多样性(H)分别为0.795 2、0.543 5、0.826 5和0.820 2;杂交种间的非加权配对算术平均(UPGMA)聚类结果与其谱系分析结果基本一致,可实现对一些未知来源的育成品种资源进行祖先亲本类型的推测。

关键词： 高山杜鹃 DNA提取 SSR引物筛选 系谱 亲缘关系