科研产出
青枯病菌(Ralstonia solanacearum)对马铃薯根系分泌物的影响
《西南农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：[目的]探索青枯病菌(Ralstonia solanacearum)胁迫下马铃薯根际分泌物种类和代谢途径的变化及其影响机制,明确根系分泌物与病原微生物,以及由根系分泌物介导的植物-病原微生物-微生态之间的关系.[方法]基于LC-MS技术,分析青枯病原菌胁迫对马铃薯根系分泌物组成的影响,通过PCA、PLS-DA、单因素方差分析多元统计方法,探究根系分泌物的差异及代谢通路.[结果]马铃薯根系分泌物在接种青枯病菌3 d后成分差异随侵染时间增加而逐渐增大,共鉴定差异代谢产物10类1619种;随接种时间增加,糖类、核酸类、次级代谢因子等38种化合物也随之增加;而抗生素类、酰胺类等12种化合物含量随青枯病菌接种时间的延长而减少;青枯病菌接种对ABC转运蛋白代谢、赖氨酸降解、色氨酸代谢这3种代谢通路的影响严重.[结论]青枯病菌侵染马铃薯后,随着侵染时间增加,马铃薯根系分泌物成分差异逐渐增大,差异代谢物种类也随之增多.青枯病菌侵染通过降低ABC转运蛋白通路下化合物合成影响其蛋白合成,促进赖氨酸降解,调节吲哚乙酸合成,从植物生长调控、抗逆性改变及次生代谢物合成等方面影响马铃薯抗病能力.
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植物病原细菌(Ralstonia solanacearum)染色体基因组分泌信号肽计算机分析
《西南农业学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：应用SignalP 3.0、TMHMM 2.0、THUMBUP、big-PI、TargetP1.01、Lipop 1.0、TatP 1.0等7种软件对植物病原细菌Ralstonia solanacearum GMI1000染色体基因组3448个氨基酸序列进行预测分析。结果表明,该物种染色体基因组分泌信号肽ORFs有178个,占其基因组编码ORFs的5.2%,其中有150个ORFs属于Ⅰ型分泌信号肽,28个ORFs属于Ⅱ型分泌信号肽。在178个ORFs中具RR-motif信号肽结构的有13个,其中11个属于Ⅰ型信号肽,2个属于Ⅱ型信号肽。通过软件预测未发现Comc型信号肽与细菌素-信息素型信号肽结构。在染色体分泌信号肽ORFs中,有116个具可预测功能,其余62个为功能未知的推定蛋白。已知功能主要集中于细胞代谢、细胞调控及转运、细胞膜结构等领域,这些功能是该物种在长期进化过程中与环境中各种因子发生互作,相互适应的结果。
关键词： Ralstonia solanacearum GMI1000 染色体基因组 分泌信号肽
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