水稻白叶枯病菌无毒新基因的克隆和序列分析

梁斌; 张鑫军; 杨晨; 郭滨; 戴陆园; 余腾琼; 沈大棱; 《复旦学报(自然科学版) 》 2005 北大核心 CSCD

摘要：从菲律宾水稻白叶枯病菌9a生理小种的代表菌株PXO339中克隆到一个新的无毒基因,全长2118bp,编码705个氨基酸,分子质量和等电点分别约为74.7ku和6.585.NCBI网站BLAST表明,该基因属于avrBs3基因家族,命名为arp3.与所有avrBs3同源基因的Alignment分析发现,arp3的5’端缺少了两个长度分别是144bp和45bp的片断,但在水稻白叶枯病菌中,arp3基因的5’端的特征很普遍.全长的arp3基因中间区域是一个特异的只有5.5次102bp的重复区,是已克隆的avrBs3基因家族中重复次数最少的一个.C-端有3个核定位信号NLSs和1个酸性转录激活域AAD.

关键词： 水稻白叶枯病菌 无毒基因 arp3 AvrBs3相似蛋白