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水稻白叶枯病菌无毒新基因的克隆和序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 梁斌 1 ; 张鑫军 1 ; 杨晨 1 ; 郭滨 1 ; 戴陆园 2 ; 余腾琼 2 ; 沈大棱 1 ;

作者机构: 1.复旦大学生命科学学院遗传学研究所

2.云南省农科院农作物品种资源站

关键词: 水稻白叶枯病菌;无毒基因;arp3;AvrBs3相似蛋白

期刊名称: 复旦学报(自然科学版)

ISSN: 0427-7104

年卷期: 2005 年 44 卷 04 期

页码: 62-67

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 从菲律宾水稻白叶枯病菌9a生理小种的代表菌株PXO339中克隆到一个新的无毒基因,全长2118bp,编码705个氨基酸,分子质量和等电点分别约为74.7ku和6.585.NCBI网站BLAST表明,该基因属于avrBs3基因家族,命名为arp3.与所有avrBs3同源基因的Alignment分析发现,arp3的5’端缺少了两个长度分别是144bp和45bp的片断,但在水稻白叶枯病菌中,arp3基因的5’端的特征很普遍.全长的arp3基因中间区域是一个特异的只有5.5次102bp的重复区,是已克隆的avrBs3基因家族中重复次数最少的一个.C-端有3个核定位信号NLSs和1个酸性转录激活域AAD.

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