滇黑两省黄瓜花叶病毒南瓜分离物外壳蛋白基因序列分析

杨国慧; 张仲凯; 崔崇士; 《园艺学报 》 2006 北大核心 CSCD

摘要：利用免疫捕捉多聚酶链式反应(Immuno-Capture PCR,IC-PCR)方法从南瓜的两个黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)云南分离物(CMV-YN)和黑龙江分离物(CMV-HLJ)中扩增获得约700bp的外壳蛋白(Coat protein,CP)基因片段,并克隆到pGEM-T载体中。核苷酸序列测定表明,CMV-HLJ和CMV-YN两个分离物CP基因长为657bp,编码219个氨基酸,两个分离物的核苷酸和氨基酸同源性分别达到96.8%和97.4%。和国外CMV亚组Ⅰ6个分离物核苷酸序列同源性在90%以上,氨基酸同源性在97%以上,和亚组Ⅱ6个分离物的同源性分别为66.4%和73.4%。和国内亚组Ⅰ10个分离物的核苷酸同源性都在89.5%以上,氨基酸同源性在93%以上,而和亚组Ⅱ两个分离物的同源性分别为68.3%和73.5%。序列分析结果表明CMV-HLJ和CMV-YN两个分离物属于CMV亚组Ⅰ。

关键词： 南瓜 CMV IC-PCR CP基因