甘蔗KNOX基因(Sckn1)的电子克隆及生物信息学分析

李旭娟; 刘洪博; 林秀琴; 吴转娣; 徐超华; 刘新龙; 《基因组学与应用生物学 》 2015 北大核心 CSCD

摘要：KNOX基因对植物顶端分生组织的形成和维持有至关重要的作用。本文选择功能已知的水稻KNOX基因(OSH1,Oskn1)为参考序列,采用电子克隆技术克隆到甘蔗中与OSH1同源的一个KNOX基因Sckn1,并通过生物信息学分析预测该基因的结构、功能。结果表明:该基因包含一个1 071 bp的开放阅读框,编码356个氨基酸,分子量为39.36 kD,理论等电点为6.47。该基因很可能定位于细胞核,起转录调控作用,序列比对发现该基因编码蛋白与高粱、玉米、小米草等KN1蛋白高度相似。以上分析结果为进一步研究Sckn1基因的功能奠定了坚实的基础。

关键词： 甘蔗 KNOX基因 电子克隆 生物信息学分析