百合AP2/ERF家族转录因子基因LoERF4的克隆和生物信息学分析

王浩; 孙亮; 张济民; 贾文杰; 吴雅文; 张小平; 李想; 王有国; 《云南农业大学学报(自然科学) 》 2022 北大核心 CSCD

摘要：【目的】研究AP2/ERF家族成员ERF基因在百合休眠解除过程中的作用。【方法】以百合品种西伯利亚(Lilium oriental ‘Siberia’)的小鳞茎为试验材料，从前期试验获得的转录组测序数据中筛选得到1个在小鳞茎休眠解除过程中显著上调表达的ERF转录因子，结合RT-PCR技术扩增得到西伯利亚小鳞茎的ERF基因c DNA全长序列，命名为LoERF4；通过多种生物信息学软件对LoERF4的基因结构和理化性质等进行分析；利用荧光定量qRT-PCR技术检测LoERF4基因在小鳞茎休眠解除过程中的相对表达量。【结果】通过克隆得到LoERF4基因全长，该基因开放阅读框全长为606 bp，编码201个氨基酸，含有1个典型的保守AP2结构域；蛋白相对分子量约为21.52 ku，理论等电点为6.43，为亲水性蛋白，没有跨膜结构。qRT-PCR分析结果显示：在西伯利亚小鳞茎休眠解除过程中，该基因的表达量在第20天小鳞茎休眠解除、开始萌发时极显著升高。【结论】在百合中克隆得到的LoERF基因可能是参与调控百合小鳞茎休眠解除进程的关键因子之一。

关键词： 百合(Lilium spp.) LoERF4 基因克隆 生物信息学分析