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资源类型: 中文期刊
关键词:PCR检测(模糊匹配)
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甘蔗白叶病植原体PCR检测方法的建立与应用

甘蔗糖业 2023

摘要:为建立简便、快速、特异性的甘蔗白叶病植原体检测方法,本研究根据甘蔗白叶病植原体sec A基因设计特异引物secA-F/secA-R,建立了甘蔗白叶病植原体PCR检测方法。使用该方法可以从含有甘蔗白叶病植原体的甘蔗样品中稳定扩增出目标基因片段,片段长度为350bp。本方法的最低检测浓度为50 fg/μL。应用该方法对云南耿马蔗区采集的7份甘蔗白叶病样品进行了检测鉴定,结果表明,所有样品均为阳性。以上结果表明,本研究建立的甘蔗白叶病植原体PCR检测方法特异性和敏感性好,操作简便,适用于甘蔗白叶病植原体的快速检测。

关键词: 甘蔗白叶病 植原体 secA基因 PCR检测

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广西宜州甘蔗白条病调查及分子检测

植物检疫 2023 北大核心

摘要:甘蔗白条病是一种检疫性细菌病害,具有危害性大,潜伏期长的特点,由白条黄单胞菌(Xanthomonas albilineans)引起,在种植甘蔗的主要国家或地区均有发生.2020年在广西宜州蔗区发现疑似感染甘蔗白条病蔗株,为明确病原及发生情况,为其科学防控提供科学依据.本研究对不同甘蔗品种新植和宿根蔗进行发病率调查,并采集病样进行PCR检测分析.田间调查结果显示:不同品种自然发病率不同,桂糖44新植和宿根蔗均有白条病发生,且宿根蔗发病率高于新植蔗,其中新植蔗发病率为8%~18%,平均发病率为13.83%;宿根蔗发病率为18%~34%,平均发病率为24.71%.而桂糖42、桂糖55、柳城05-136等3个品种新植和宿根蔗均未发现白条病.PCR检测结果表明:有10份样品扩增出608bp的特异性条带,阳性检出率为90.9%,所得序列与X.albilineans序列同源性高达100%,且在构建的系统发育树处于同一分支.本研究结果表明,广西宜州蔗区发现由X.albilineans引起的甘蔗白条病.

关键词: 广西 甘蔗白条病 发病率 PCR检测 系统发育分析

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广西南宁甘蔗赤条病调查及分子检测

植物保护 2022 北大核心 CSCD

摘要:2020年在广西南宁市金光农场发现‘桂糖58’和‘柳城05-136’疑似感染甘蔗赤条病,为明确其病原,本研究对不同甘蔗品种进行了发病率调查,并采集病样进行了PCR检测分析。田间调查结果表明:不同品种自然发病率不同,‘桂糖58’发病率为29%~52.33%,发病严重田块平均发病率为49.67%,发病中等田块平均发病率为33.67%,发病较轻田块平均发病率为29.89%;‘柳城05-136’发病率为2%~27.67%,发病严重田块平均发病率为21.67%,发病中等田块平均发病率为21.22%,发病较轻田块平均发病率为4.67%。PCR检测分析表明:有19份样品扩增出550 bp的特异性条带,阳性检出率为95%,测序序列与Acidovorax avenae subsp.avenae序列同源性高达100%,且在构建的系统发育树上处于同一分支,证实检测样品为A.avenae subsp.avenae感染引起的甘蔗赤条病。本研究结果表明,‘桂糖58’为高感品种,‘柳城05-136’为感病品种,今后应积极采取相应防控措施,防治该细菌病害扩展蔓延,确保我国蔗糖产业安全可持续发展。

关键词: 广西 甘蔗赤条病 发病率 PCR检测 系统发育分析

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示范甘蔗新品种梢腐病病原的检测鉴定

中国植保导刊 2022 北大核心

摘要:甘蔗梢腐病是由镰刀菌引起的一种世界性甘蔗重要病害.为明确云南开远综合试验站示范甘蔗新品种上2种梢腐病病原菌的发生情况,使用检测Fusarium verticillioides和Fusarium proliferarum的特异性引物,对采自云南开远综合试验站的15份典型甘蔗梢腐病样品进行PCR分子检测,在14份样品中检出F.verticillioides+F.proliferarum复合侵染,复合侵染率为93.33%.测序结果显示,检出的F.verticillioides扩增产物序列与F.verticillioides(GenBank登陆号KU508286),F.proliferarum扩增产物序列与F.proliferarum(GenBank登陆号MZ447573)同源性均高达100%,经系统发育分析,两者分属于E proliferarum组和F.proliferarum组.研究结果表明,开远综合试验站示范甘蔗新品种梢腐病病原菌主要有F.verticillioides和F.proliferarum,且复合侵染现象较普遍.

关键词: 甘蔗梢腐病 病原菌 新品种 PCR检测

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广西蔗区检测发现检疫性病害甘蔗白条病

中国农学通报 2018

摘要:为明确2016年在广西北海、来宾、百色蔗区发现的疑似甘蔗白条病症状蔗株致病病原。利用白条黄单胞菌特异性引物XAF1/XAR1对采自这3个蔗区的62份疑似病样进行PCR检测鉴定。鉴定结果表明:62份疑似病样都能够获得约600 bp的特异性片段,所得序列完全一致大小均为608 bp(Gen Bank登录号:KY315183--KY315203),其与白条黄单胞菌rax B1基因核苷酸序列(Gen Bank登录号:FP565176)一致性为100%,在系统进化树中处于同一分支。田间调查结果显示:甘蔗品种‘桂糖46号’、‘桂糖06-2081’对于白条黄单胞菌高度感病,病株率一般为18%~50%,严重田块高达100%;染病严重蔗株全叶枯萎,茎的节部长出许多侧芽,侧芽叶片具白色条纹,造成大幅度减产减糖。本研究在广西蔗区检测发现由白条黄单孢菌引起的检疫性病害甘蔗白条病。

关键词: 广西蔗区 甘蔗白条病 PCR检测 白条黄单胞菌 序列分析

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甘蔗不同部位宿根矮化病分子检测研究

中国糖料 2013

摘要:运用PCR检测技术对粤糖93-159和ROC25的不同部位进行了RSD检测,结果表明,在同一个样品的5次重复检测中,两个品种叶片的平均检出率为20%,叶鞘的平均检出率为90%,茎尖的平均检出率为40%,茎部组织和蔗汁的平均检出率均为100%。本研究表明今后可以使用甘蔗茎部组织或叶鞘代替蔗汁进行RSD的检测。

关键词: 甘蔗 宿根矮化病 PCR检测

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甘蔗黑穗病菌DNA提取及PCR检测

西南农业学报 2012 北大核心 CSCD

摘要:本研究利用尿素混合液直接从甘蔗黑穗病菌孢子提取基因组DNA进行PCR检测鉴定,经过反复试验,建立了一种简便、快速的检测鉴定方法。利用建立的方法对12个甘蔗黑穗病样品进行病菌基因组DNA提取,将甘蔗黑穗病菌特异性引物进行PCR检测,均扩增出大小为420 bp的预期DNA片段条带。PCR扩增产物经克隆测序,与GenBank数据库中的甘蔗黑穗病病原菌序列比对,同源性达99%。

关键词: 甘蔗黑穗病菌 基因组DNA 提取方法 PCR检测

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甘蔗宿根矮化病菌PCR检测体系的优化与应用

云南农业大学学报(自然科学版) 2011 北大核心 CSCD

摘要:为建立能快速灵敏检测甘蔗宿根矮化病(ratoon stuning disease,RSD)的PCR检测方法。本文通过改进模板DNA的制备方法,在PCR基本程序的基础上,以甘蔗宿根矮化病菌(Leifsonia xyli subsp.xyli,Lxx)16S-23SrDNA基因间隔区特异性引物,调整PCR扩增反应体系各组分的浓度、反应的退火温度、循环参数等主要因子,优化PCR反应体系。此检测体系能从感染RSD的样品中扩增出大小为438 bp的特异性片段,而阴性对照和未感染样品则未扩增出任何片断;未优化仅从稀释30倍的蔗汁总DNA中扩增出RSD的特异性片段,优化后可以从稀释3 000倍的蔗汁总DNA中扩增出RSD的特异性片段。对31份田间采集样品检测,未优化的阳性检出率为32.26%;优化后阳性检出率74.19%,与I-ELISA检测结果一致。应用此检测方法可稳定、快速地检测出蔗株是否感染RSD,且检测效率高,适合于田间大批量样品快速检测。

关键词: 甘蔗宿根矮化病菌 PCR检测 16S-23SrDNA 间接酶联免疫吸附法

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百合疫病病原鉴定及其PCR检测

园艺学报 2011 北大核心 CSCD

摘要:对从百合疫病病株上分离得到的病原菌进行了形态特征观察、致病性测定及核糖体DNA-ITS序列分析。结果表明,该菌为疫霉属真菌,与GenBank中烟草疫霉ITS序列的同源性为98%~99%。结合病原菌PCR检测结果,进一步证实其为烟草疫霉菌(Phytophthora nicotianae)。这是烟草疫霉菌侵染云南切花百合的首次报道。

关键词: 百合 疫病 病原鉴定 PCR检测

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香料烟粉虱传双生病毒的分子检测

西南农业学报 2007 CSCD

摘要:发生在保山香料烟生产区粉虱传双生病毒病,已严重影响到了香料烟的品质和产量。本研究利用PCR技术快速检测香料烟植株及田间其它植物如胜红蓟、赛葵及菜豆等、以及病毒介体的带毒情况。对部分样品的PCR检测及序列分析表明,感染香料烟双生病毒有中国番茄黄曲叶病毒、番茄黄曲叶病毒、云南烟草曲茎病毒、烟草曲茎病毒以及云南烟草曲叶病毒等,且一些样品存在复合侵染现象。本研究为掌握病害发生流行的基本规律,监控病害在香料烟上的发生流行提供了依据。

关键词: 粉虱传双生病毒 香料烟 PCR检测

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