野生蒜芥茄SsRPM1基因的生信分析、亚细胞定位及表达分析

胡雨莹; 孙茂; 汪骞; 黎志彬; 鲍锐; 桂敏; 钟秋月; 杜光辉; 吴丽艳; 《华北农学报 》 2025 北大核心 CSCD

摘要：为了探究NBS-LRR类基因RPM1在茄属植物抗黄萎病中的作用，以茄属中的野生茄-蒜芥茄为材料，在其转录测序的基础上，克隆RPM1基因同源序列，分析该序列编码蛋白的理化性质、分子结构，构建进化树，以及在烟草中进行亚细胞定位，同时检测蒜芥茄不同部位中RPM1基因的相对表达量，以及在接种大丽轮枝菌(黄萎病病原菌的一种)后4个时间点(0,24,48,72 h)的相对表达量。结果发现，在蒜芥茄中RPM1基因(命名为SsRPM1)序列全长2 772 bp,编码924个氨基酸。SsRPM1蛋白总分子质量为105.99 ku,是不存在跨膜结构的碱性亲水蛋白，该蛋白主要由α螺旋和无规卷曲构成，包括LRR、NBC和CC 3种结构域，欧白英RPM1蛋白与其亲缘性关系最近；在烟草中的亚细胞定位发现该蛋白位于细胞膜上；SsRPM1基因在蒜芥茄的不同器官(根、茎、叶)中均有表达，其中茎的相对表达量最高，其次是叶，最后是根。在接种大丽轮枝菌后，总体上看，对照组和接菌处理组的SsRPM1基因表达情况皆呈现先上升后下降的趋势，在24 h最高。与对照组相比，接菌处理组的基因相对表达量较低，暗示蒜芥茄SsRPM1是响应黄萎病胁迫的负调控基因。

关键词： 野生茄 RPM1基因 黄萎病 生物信息学 亚细胞定位 基因表达