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野生蒜芥茄SsRPM1基因的生信分析、亚细胞定位及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 胡雨莹 1 ; 孙茂 1 ; 汪骞 1 ; 黎志彬 1 ; 鲍锐 1 ; 桂敏 1 ; 钟秋月 1 ; 杜光辉 2 ; 吴丽艳 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院园艺作物研究所

2.云南大学农学院

关键词: 野生茄;RPM1基因;黄萎病;生物信息学;亚细胞定位;基因表达

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2025 年 40 卷 003 期

页码: 27-33

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了探究NBS-LRR类基因RPM1在茄属植物抗黄萎病中的作用,以茄属中的野生茄-蒜芥茄为材料,在其转录测序的基础上,克隆RPM1基因同源序列,分析该序列编码蛋白的理化性质、分子结构,构建进化树,以及在烟草中进行亚细胞定位,同时检测蒜芥茄不同部位中RPM1基因的相对表达量,以及在接种大丽轮枝菌(黄萎病病原菌的一种)后4个时间点(0,24,48,72 h)的相对表达量。结果发现,在蒜芥茄中RPM1基因(命名为SsRPM1)序列全长2 772 bp,编码924个氨基酸。SsRPM1蛋白总分子质量为105.99 ku,是不存在跨膜结构的碱性亲水蛋白,该蛋白主要由α螺旋和无规卷曲构成,包括LRR、NBC和CC 3种结构域,欧白英RPM1蛋白与其亲缘性关系最近;在烟草中的亚细胞定位发现该蛋白位于细胞膜上;SsRPM1基因在蒜芥茄的不同器官(根、茎、叶)中均有表达,其中茎的相对表达量最高,其次是叶,最后是根。在接种大丽轮枝菌后,总体上看,对照组和接菌处理组的SsRPM1基因表达情况皆呈现先上升后下降的趋势,在24 h最高。与对照组相比,接菌处理组的基因相对表达量较低,暗示蒜芥茄SsRPM1是响应黄萎病胁迫的负调控基因。

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