基于BSA的玉米花期相关性状基因定位

孙家臣; 蒋辅燕; 尹兴福; 毕亚琪; 郭瑞佳; 胡灿; 王宇玲; 番兴明; 《玉米科学 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：通过自交系R146与其早花期自然突变体ER146构建901个单株的F2群体，利用集群分离分析（BSA）中的欧氏距离（ED）算法与ΔSNP-index/ΔInDel-index算法，获得控制吐丝期性状基因的候选区间和位点，对候选基因进行功能注释。结果表明，通过ED值算法获得全基因组内最大的3号染色体上的ED关联区间，基于上述ED关联区间进一步通过ΔSNP-index/ΔInDel-index算法在此区间内检测出1个0.268 Mb的主效区间和19个微效位点。基因功能注释结果发现，主效区间内的1个基因和微效位点中的5个基因与玉米花期相关，此外还在主效区间发现了2个潜在的新基因。

关键词： 玉米 花期 集群分离分析 基因定位 欧氏距离