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基于BSA的玉米花期相关性状基因定位

文献类型： 中文期刊

作者： 孙家臣 1 ; 蒋辅燕 2 ; 尹兴福 2 ; 毕亚琪 2 ; 郭瑞佳 2 ; 胡灿 3 ; 王宇玲 3 ; 番兴明 2 ;

作者机构： 1.云南农业大学农学与生物技术学院

2.云南省农业科学院粮食作物研究所

3.云南大学资源植物研究院

关键词： 玉米;花期;集群分离分析;基因定位;欧氏距离

期刊名称： 玉米科学

ISSN：

年卷期： 2023 年 003 期

页码： 48-57

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过自交系R146与其早花期自然突变体ER146构建901个单株的F2群体，利用集群分离分析（BSA）中的欧氏距离（ED）算法与ΔSNP-index/ΔInDel-index算法，获得控制吐丝期性状基因的候选区间和位点，对候选基因进行功能注释。结果表明，通过ED值算法获得全基因组内最大的3号染色体上的ED关联区间，基于上述ED关联区间进一步通过ΔSNP-index/ΔInDel-index算法在此区间内检测出1个0.268 Mb的主效区间和19个微效位点。基因功能注释结果发现，主效区间内的1个基因和微效位点中的5个基因与玉米花期相关，此外还在主效区间发现了2个潜在的新基因。

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