科研产出
抗稻瘟病基因Piz-t和Pi9连锁标记开发及在云南粳稻中的应用
《西南农业学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：云粳优5号、云资粳41号和楚粳28号是农艺性状优良但对稻瘟病抗性弱的粳稻品种,采用回交的方法将2个广谱抗稻瘟病的基因Piz-t和Pi9导入这些品种以改良这3个品种的抗稻瘟病特性。为提高后代抗病材料选择的准确性和效率,本研究开发获得5个与Piz-t和Pi9基因紧密连锁并且在供体亲本和受体亲本间具有多态性的分子标记。利用分子标记跟踪检测来源于供体亲本与受体亲本回交获得的BC1F1单株中Piz-t和Pi9基因,并进一步利用对受体亲本云粳优5号、云资粳41号和楚粳28号致病,但对持有Piz-t和Pi9基因的供体亲本不致病的稻瘟病菌09BSH-10-5A进行接种分析。结果显示,携带有供体亲本和受体亲本DNA片段的杂合单株均表现抗病,而仅携带受体亲本DNA片段的个体均表现为感病。表明所开发的5个分子标记可用于抗病育种的分子标记辅助选择,有效提高抗病材料选拔的准确性与效率,创制新的抗源材料。
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基于RAPD的SCAR标记初步定位油菜温敏雄性不育系K121S的育性转换基因
《分子植物育种 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：温敏雄性不育系具有育种程序简单、组配自由、育种周期短等优点,已成为杂种优势利用的重要材料。本研究以芥菜型(Brassica juncea L.)油菜温敏雄性不育系K121S与核不育系1161A获得的BCF1为作图群体,利用混合分组分析法(bulked-segregant analysis BSA)对温敏雄性不育系K121S的育性转换基因(Fc)进行定位。结果表明获得2个基于RAPD的SCAR标记与育性转换基因(Fc)连锁,即是SS503-250和SBA485-482,与育性转换基因的遗传距离分别为3.94 c M和7.09 c M。本研究结果为今后育性转换基因的克隆、测序及生物信息学研究并解析K121S育性转换的分子机制机制提供了条件。
关键词： 油菜 温敏雄性不育系 育性转换基因(Fc) 基因定位 分子标记
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基于RNA-Seq技术的茶树花转录组分析
《西南农业学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：本研究利用RNA-seq技术对父本、母本、子代不育茶树花三个样本花的转录组进行测定,经组装分析获得403 469条高质量的Unigenes。将获得的Unigenes与SWISS-PROT、TREMBL、CDD、PFAM、NR和KOG库进行blast,共注释到307 291条Unigenes。KOG功能分类显示,有23 739个Unigenes被分为25类。KEGG通路分析表明,共识别出26 967个Unigenes涉及的pathway有328个。SSR查找发现,从403 469个Unigenes中找到46 440个含有SSR序列。这些信息为茶树不育基因筛选、不育机理研究以及分子标记开发奠定了基础。
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油菜温敏雄性不育系K121S育性转换基因的分子定位
《分子植物育种 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：本研究以芥菜型油菜(Brassica juncea L.)核不育系1161A和温敏雄性不育系K121S的BCF1为作图群体,采用混合群体分组分析法(bulked segregant analysis,BSA)定位油菜温敏雄性不育系K121S的育性转换基因(Fc)。研究结果表明,从86对多态性SSR引物中获得了5个连锁标记:Ol11-G11a、Na10-F06、Na14-G10、CN48和Br GMS961,其中Ol11-G11a、Na14-G10和Na10-F06等3个SSR标记与K121S育性转换基因的遗传距离较近,分别为1.6 c M、11.0 c M和19.7 c M。本研究结果可为油菜温敏雄性不育系K121S的育性转换基因的图位克隆及其利用提供依据。
关键词： 油菜 温敏雄性不育 育性转换基因(Fc) 基因定位 分子标记
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利用分子标记数据逐步聚类取样构建甘蔗杂交品种核心种质库
《作物学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：甘蔗杂交品种是商业品种选育的重要亲本资源,为有效管理和评价这类资源,本研究使用SSR分子标记数据,依据不同相似性系数,采用逐步UPGMA聚类法对161份甘蔗杂交品种(136份来自前期构建的初级核心种质库和25份为新引入国家甘蔗种质资源圃的材料)构建核心种质库,以随机取样方法为对照。在核心种质库质量检测中,用Nei’s多样性指数、Shannon-Wiener多样性指数、总条带数、多态性条带数、多态性条带比例、变异系数符合率、极差符合率、方差差异百分率和均值差异百分率评价分析。结果表明,161份材料在20个SSR位点上具有丰富的多态性,获得294个条带,其中290个为多态性条带,平均多态性条带比例达98.64%;依据3种相似性系数(Jaccard、SM、Dice)和2种取样方法获得8个核心种质库,在核心种质库质量检测中Shannon-Wiener多样性指数、总条带数、多态性条带数表现出较高的检测效率,而其他指标相对较低,8个库中依据Jaccard或Dice相似性系数构建的核心种质库质量最优,该库由107份材料组成,Nei’s多样性指数(0.9785)和Shannon-Wiener多样性指数(4.1854)在P<0.05概率条件下与原库(分别为0.9801和4.4074)无显著差异,而且与原库的均值差异百分率为0(<20.00%),极差符合率为94.32%(>80.00%),对原库分子和农艺性状遗传多样性都具有较好的代表性,可为后续甘蔗杂交品种资源的准确评价、优异基因发掘和开发利用提供重要的前期基础。
关键词： 甘蔗杂交品种 分子标记 核心种质库 聚类 多样性指数
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分子标记技术在家蚕遗传育种研究中的应用
《北方蚕业 》 2013
摘要：介绍了分子标记的类型,简述了分子标记技术在家蚕的分类、进化及遗传多样性分析、遗传图谱构建及基因定位、品种鉴别和分子标记辅助选择方面的应用进展,并对分子标记技术在家蚕遗传育种研究领域的应用前景进行了展望。
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利用SSR分子标记检测云南地方稻种抗稻瘟病基因Pi-ta~2的研究
《中国农业科技导报 》 2012 CSCD
摘要：垂直抗性基因Pi-ta2在云南抗稻瘟病育种中具有重要的利用价值。利用与抗稻瘟病基因Pi-ta2连锁的SSR引物OSR32对云南地方稻种二级核心种质中的220份抗性基因Pi-ta2进行了检测,并选择15份材料进行了人工接种鉴定。分子标记检测表明,123份籼稻有25份含有Pi-ta2基因,占20.3%;97份粳稻有51份含有该基因,占52.58%,粳稻比籼稻高;携带Pi-ta2基因的材料分布在云南5个稻区中的29个县,较为广泛,南部边缘和滇东北高原粳稻区分布点较多。结果表明,人工接种鉴定与分子鉴定结果完全相符,验证了SSR引物OSR32鉴定抗稻瘟病基因Pi-ta2的可行性。初步明确了Pi-ta2基因在云南地方稻种资源中的分布情况,对水稻抗性基因发掘和品种布局具有指导作用。
关键词： 云南 地方稻种 稻瘟病 Pi-ta2基因 分子标记
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水稻近等基因系中5个抗旱主效QTL的验证
《分子植物育种 》 2012 CSCD
摘要：为了验证5个抗旱主效QTL的导入效果,将已精细定位的5个抗旱主效QTLs(DTY1.1,DTY2.1,DTY2.2,DTY3.1和DTY12.1)作供体建立近等基因系,利用与5个QTL位点紧密连锁的16个SSR分子标记对导入抗旱主效基因的23份家系进行目标QTL检测。结果显示,利用6个标记同时检测,获得携带DTY3.1 QTL的家系5株;利用2个标记同时检测,获得携带DTY12.1 QTL的家系5株;其他3个QTL位点未检测到目标QTL的家系;没有同时获得具备不同抗旱QTL的家系。相比较而言,携带DTY3.1 QTL以Apo为供体及携带DTY12.1 QTL以Way Rarem为供体导入效果更好。这些抗旱家系的获得,为抗旱品种的选育提供了新的抗旱基因来源。
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利用分子标记和接种鉴定分析美国水稻育种亲本的稻瘟病抗性
《分子植物育种 》 2012 CSCD
摘要：稻瘟病是由真菌Magnaporthe oryzae引起的,水稻与稻瘟病菌的互作符合经典的"基因对基因"学说,抗稻瘟病基因Pi-ta可有效防治携带AVR-Pita1稻瘟菌的侵染。本研究利用位于Pi-ta基因前端的显性分子标记YL153/YL153和位于中间区域的显性分子标记YL155/YL87对39份来自美国的水稻种质进行Pi-ta基因检测,同时利用携带AVR-Pita1的稻瘟病生理小种IC-17、IB-49、IB-1、IE-1、IG-1和IH-1接种鉴定39份水稻种质的抗病性。结果表明,39份育种亲本中,分子标记YL153/YL154和YL155/YL87鉴定均持有Pi-ta基因的有26份,其中接种鉴定表现抗病的亲本有21份,感病的亲本有5份;两对分子标记鉴定不持有Pi-ta基因的有11份,其中接种鉴定表现抗病的亲本有7份,感病的亲本有4份;两对分子标记鉴定结果不一致的亲本有2份,即一对分子标记鉴定持有Pi-ta基因,另一对分子标记鉴定无Pi-ta基因,接种鉴定均表现感病,这一发现对进一步研究Pi-ta基因的功能具有重要意义。由此说明,在水稻育种中,选择抗稻瘟病亲本时,分子标记检测和接种鉴定都是重要的。
关键词： 水稻 抗稻瘟病基因Pi-ta 接种鉴定 分子标记
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