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资源类型: 中文期刊
关键词:模糊聚类分析(模糊匹配)
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当归HPLC指纹图谱建立及化学计量学评价

中成药 2020 北大核心 CSCD

摘要:目的建立当归HPLC指纹图谱,并结合化学计量学评价其质量。方法当归3%甲酸甲醇提取物的分析采用Waters Symmetryshield C_(18)柱(4.6 mm×250 mm,5μm);流动相乙腈-0.5%的醋酸水,梯度洗脱;体积流量1.0 mL/min;柱温30℃;检测波长254 nm。并对结果进行聚类分析及主成分分析。结果 35批样品指纹图谱中有24个共有峰,相似度0.824~0.989;聚类分析将样品分为3类,云南单独聚为一类,结果与相似度评价一致;主成分分析确定6、7、13、17、18号色谱峰为主要成分。结论该方法简单、稳定、重现性好,可用于当归的质量控制。

关键词: 当归 指纹图谱 化学计量学 聚类分析 主成分分析 HPLC

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马铃薯重要农艺性状的相关性、主成分与聚类分析

分子植物育种 2020 北大核心 CSCD

摘要:为明确国内外马铃薯种质资源在云南大春季的表现,本研究对68份马铃薯品种(系)的出苗率、长势、主茎数、茎粗、株高、开花性、病情发展曲线下面积(area under disease progress curve, AUDPC)、成熟期、商品率、单株块茎数、单株块茎重、平均块茎重、匍匐茎数量、匍匐茎长度共14个农艺性状进行相关性、主成分与聚类分析.结果表明:单株块茎数、AUDPC、单株块茎重、开花性的变异程度较明显,变异系数分别为50.42%、43.91%、39.81%和39.67%;单株块茎重与长势、茎粗、株高、开花性、商品率、平均块茎重、匍匐茎数量极显著正相关,与单株块茎数显著正相关,与成熟期极显著负相关.AUDPC与成熟期极显著正相关且相关系数达到0.802.在主成分分析中,前6个主成分方差累积贡献率为83.290%,可用来代替14个农艺性状指标.聚类分析将68份马铃薯品种(系)分为3个类群,Ⅰ类群表现为晚熟、高抗晚疫病病,Ⅱ类群表现为中熟、中抗晚疫病,第Ⅲ类群表现为早熟感晚疫病.本研究结果为云南大春马铃薯种质资源的合理利用提供了科学依据.

关键词: 马铃薯(Solanum tuberosum) 品种(系) 农艺性状 相关性 主成分 聚类分析

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基于因子分析和聚类分析的花椰菜种质矿质元素含量评价

热带农业科学 2020

摘要:以8份花椰菜种质成熟期的花球为试材,测定其19种矿质元素含量,采用相关性分析、因子分析、聚类分析等统计方法对矿质元素含量特征进行分析评价.结果表明:不同花椰菜种质花球中K、P、Ca、Mg、S、Fe、Mn、B、Zn、Cu、Na、Ni、Cr、Pb、Si、Co共16种元素含量存在极显著差异(p<0.01),Se、Mo、Cd元素未检出;16种元素平均含量顺序为:K>S>P>Mg>Ca>Na>Zn>Fe>B>Mn>Cu>Cr>Ni>Si>Co>Pb,变异系数为3.39%(Mg)~70.39%(Si);相关性分析结果表明,各元素含量间存在复杂的关联性;因子分析结果表明,Ca、S、B、Mn、Na和Cr元素是花椰菜花球中的特征性元素;聚类分析可将8份花椰菜种质分为3类,第一类包含5份种质,该类种质K、Na、Fe含量较高;第二类只包含C18261,该类种质Si含量较高;第三类包含2份种质,该类种质Ca、S、B含量较高,Pb含量较低.研究结果可为进一步开展花椰菜营养特性评价、新品种选育和平衡施肥等提供数据参考.

关键词: 花椰菜 矿质元素 因子分析 聚类分析

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大茎野生种57NG208与南涧果蔗正反交F_1代材料的耐旱性评价

热带作物学报 2019 北大核心 CSCD

摘要:选用大茎野生种57NG208与南涧果蔗正反交所得的12个后代为试验材料,采用桶栽试验的方法,在甘蔗拔节初期设正常供水(CK)、轻度胁迫和重度胁迫3处理进行人工水分胁迫,分别测定3处理的形态指标及生理生化指标,利用隶属函数分析﹑灰色关联度分析和聚类分析,综合评价12份参试材料在不同水分胁迫下耐旱性的强弱。结果表明:不同水分胁迫处理对供试甘蔗主要测定指标均有显著影响;在不同水分胁迫下甘蔗叶片中的PMP、MDA含量、Pro含量、SOD和POD酶活性数值升高,CHL含量和Hight数值降低,变化幅度因水分胁迫程度及参试材料的差异而不同;隶属函数分析结果表明,在不同水分胁迫下,大茎野生种57NG208与南涧果蔗正交材料排在前5位的数量比其反交多;聚类分析表明,所有参试材料在轻度、重度水分胁迫下,均可分为4大类别,云瑞2012-9-11和云瑞2012-38-81的耐旱性较好,无论轻度、重度水分胁迫处理均聚为一类;灰色关联度分析表明,在不同程度的水分胁迫下,各项测定指标与耐旱性间的关联度不同,CHL、Pro和POD等3项生理生化指标与甘蔗耐旱性关联度较高,是甘蔗耐旱性评价的优良指标。

关键词: 甘蔗 大茎野生种 南涧果蔗 正反交 灰色关联度分析 聚类分析

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基于农艺性状分级对317份甘蔗种质资源的评价

中国农业科学 2019 北大核心 CSCD

摘要:【目的】采用重要农艺性状快速分级的方法对甘蔗种质资源进行评价,为种质资源的进一步精准评价和杂交利用提供参考。【方法】基于大田试验,在成熟期选择株高、茎径、有效茎、叶部病害程度(花叶病、锈病、褐条病等叶部病害田间自然发病的综合反映)和总体生势等5个重要农艺性状,对317份国内外甘蔗种质资源(2重复)进行分级评价。每个性状分为5级,其中株高以1级为最高,依次递减,5级最矮;同理,茎径以1级最粗,5级最细;有效茎以1级最多,5级最少;总体生势以1级最好,5级最差;叶部病害以1级为无或轻,5级最严重。各性状分级由分级小组成员共同完成。基于农艺性状分级数据,采用方差、广义遗传力、主成分、聚类和判别分析等统计方法,对317份种质资源进行综合评价分析,筛选农艺性状表现优良的种质资源。并在此基础上,采用一次旋光法,对筛选出的优良种质资源甘蔗糖分进行评价。【结果】方差和广义遗传力分析结果表明,317份甘蔗种质各个农艺性状指标分级数据间均存在极显著差异(P<0.01),广义遗传力在0.61—0.72,其中广义遗传力最高为茎径(0.72),最低为株高(0.61)。主成分分析结果表明,5个农艺性状可简化为1个主成分因子,即5个农艺性状的综合叠加,且此主成分所提供的信息占全部信息量的63.57%,特征根显著高于其他主成分的特征根之和。基于主成分结果,对317份种质进行聚类分析,将其划分为5类,第Ⅰ类包含20份种质,第Ⅱ类包含97份,第Ⅲ类包含82份,第Ⅳ类包含80份,第Ⅴ类包含38份;农艺性状表现以第Ⅰ类和第Ⅱ类的117份种质资源最优(占全部种质数的36.91%)。聚类结果的逐步判别分析显示,平均判对概率为95.85%。聚类结果充分体现了种质资源在田间试验中的实际表现。基于农艺性状聚类分析结果,对第Ⅰ类和第Ⅱ类共计117份种质的甘蔗糖分进行评价。结果显示,117份种质11月至翌年3月平均蔗糖分在5.0%—17.10%,最高为云蔗09-1601(17.1%),最低为CP79-318(5.0%)。平均蔗糖分15.0%以上的种质有43份,其中有11份超过16.0%。【结论】株高、茎径、有效茎、叶部病害程度和总体生势等是反映甘蔗种质资源田间表现的重要农艺性状指标。基于重要农艺性状快速分级的方法可以作为大量甘蔗种质资源评价的另一途径。

关键词: 甘蔗 种质资源 分级数据 广义遗传力 主成分分析 聚类分析

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云南割手密创新种质F2的主成分聚类分析及其评价

植物遗传资源学报 2019 北大核心 CSCD

摘要:云南割手密是甘蔗育种中比较宝贵的野生种质资源.对68份云南割手密F2创新种质材料的9个主要工农艺性状进行主成分分析,并以前3个主成分为基础,分别作聚类分析和二维排序图.结果表明:68份云南割手密F2创新种质的变异系数为10.57%~35.30%,11月份理论含糖量和单产的变异系数超过30%,说明11月份理论含糖量和单产性状的变异潜力较高.主成分分析结果表明,单茎重产量因子、锤度糖分因子和丛有效茎含糖量这3个主因子提供了原始性状80.8292%的信息;在欧氏距离为10.00处将68份材料分为4类,各个类群具有不同的特点,在甘蔗杂交育种上可以根据不同类群的特点加以利用;二维排序表明云割F211-50、云割F211-56、云割F211-40、云割F211-66、云割F211-77、云割F211-10、云割F211-19、云割F211-85、云割F211-45、云割F211-37、云割F211-25、云割F211-23、云割F211-18等13份材料的3个主成分构成因子协调性最好,可在育种中加以利用.

关键词: 割手密 创新种质 相关分析 主成分分析 聚类分析

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基于投影寻踪分类法评价43份澳大利亚甘蔗种质资源

亚热带农业研究 2019

摘要:为合理评价国外甘蔗种质资源,利用投影寻踪分类法对43份澳大利亚甘蔗种质进行综合评价.方差分析表明,各种质主要工农艺性状存在显著差异(P<0.01),变异系数在5.31%~35.21%之间,变异广泛.对总体长势、茎径、有效茎、叶部病害、株高、蔗糖分、蔗汁糖分、锤度、简纯度和纤维分等10个主要工农艺性状指标进行投影方向和投影值大小分析表明,投影方向以叶部病害最高,其次为总体长势、茎径、有效茎、株高和蔗糖分等,简纯度和纤维分等其他品质性状最低;43份种质投影值大小各异.根据投影值大小,结合聚类分析将43份种质划分为5个类群,各类群投影均值在0.32~1.83之间,并从中筛选了13份(Ⅰ类群和Ⅱ类群)综合性状优良的种质资源.综合来看,投影寻踪分类法对43份澳大利亚甘蔗种质的评价与实践相符.

关键词: 澳大利亚 甘蔗 种质资源 投影寻踪分类法 聚类分析 评价

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大茎野生种57NG208在云瑞系列亲本创制中的利用

中国糖料 2019

摘要:在2008年至2018年的10年时间中,云南省农业科学院甘蔗研究所瑞丽育种站以大茎野生种57NG208为核心创新种质,先后与含割手密、斑茅、热带种等野生种质血缘的甘蔗亲本进行远缘杂交,创制了一批云瑞系列甘蔗亲本.本文通过对45份参试材料的亲本血缘、产量和糖分数据的整理,采用聚类分析对大茎野生种57NG208在瑞丽站甘蔗育种中的利用情况进行研究.结果表明,大茎野生种57NG208是瑞丽甘蔗育种站甘蔗杂交育种中的高频应用亲本,也是为数不多既可作为父本也可做母本使用的杂交亲本之一,其作为母本杂交应用较多,后代性状表现非常突出.采用大茎野生种57NG208与瑞丽割手密、斑茅、热带种杂交,选育了大批优良杂种后代,虽然迄今尚未育成生产品种,但近年来含大茎野生种57NG208血缘BC1、BC2杂种的育成却标志着其杂交利用取得了重大的突破.本研究参试的45份大茎野生种57NG208远缘杂交材料,有8份材料的11月份糖分超过双对照,3份材料介于双对照之间;有21份材料的蔗茎产量超过双对照,6份材料介于双对照之间;有2份材料糖分和蔗茎产量均超过双对照.

关键词: 甘蔗 云瑞系列创新亲本 大茎野生种 聚类分析

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基于主成分与聚类分析的大茎野生种血缘后代育种潜力评价

江西农业学报 2019

摘要:以12份大茎野生种血缘后代材料及生产上大面积推广种植的ROC22和粤糖93-159为试验材料,对其7个工农艺性状进行主成分和聚类分析.结果表明:供试材料各性状间存在较高相关性;主成分分析将7个性状降为3个主成分,这3个主成分能解释表型变异的95.7057%.基于3个主成分进行二维排序和聚类分析,筛选到8(云瑞14-204)和6(云瑞14-199)2份优质材料,能较好地为大茎野生种的创新利用和品种改良提供科学依据.

关键词: 大茎野生种 主成分分析 聚类分析 育种潜力

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白及属不同种质资源材料的综合评价

山西农业科学 2019

摘要:采用形态学标记研究不同来源的白及种质资源材料,以明确种间的形态差异,为分类及鉴定提供科学的理论依据.借助生物统计学知识,探究了巢氏方差分析、灰色关联分析及聚类分析在评价不同来源白及种质资源材料中所发挥的作用.结果表明,白及属种质资源的一些形态特征无论在种间还是种内都存在明显的分化和交叉;性状间的灰色关联分析表明,株高与花枝长、叶宽与唇瓣长、花瓣长与萼片长、花瓣宽与萼片宽之间的关联系数互为最大;种质资源材料间的灰色关联分析表明,白及属相同的种存在地理位置相近的资源具有最大的灰色关联关系,这与聚类分析的结果一致;聚类分析结果表明,在距离为0.678 1处可将白及属种质资源分为6类,即白及(浙江)、白及(贵州)和白及(湖北)为I类,黄花白及(浙江)、黄花白及(贵州)、黄花白及(湖北)为II类,黄花白及(丽江古城)和黄花白及(丽江玉龙)为III类,黄花白及(迪庆香格里拉)和黄花白及(迪庆维西)为IV类,小白及(丽江古城)和小白及(丽江玉龙)为V类,小白及(迪庆香格里拉)和小白及(迪庆维西)为VI类.将灰色关联分析结果与聚类分析结果相结合,可为深入研究该物种的分类、鉴别等提供有价值的参考依据,从中获得的信息也可为深入开展化学指纹图谱分析及物种间DNA条形码研究提供一定的理论依据.

关键词: 白及属 巢氏方差分析 灰色关联分析 聚类分析

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