文献类型： 中文期刊

作者： 赵筱 ¹ ; 张霞 ² ; 范俐 ³ ; 杨忠 ⁴ ; 霍金龙 ⁵ ; 曾日彬 ⁵ ; 刘丽仙 ¹ ; 霍海龙 ¹ ;

作者机构： 1.云南农业职业技术学院

2.吕梁学院生命科学系

3.云南省农业科学院粮食作物研究所

4.云南生物制药有限公司

5.云南农业大学动物科学技术学院

关键词： 猪;PYGO2;生物信息学分析;蛋白互作网络;表达分析;亚细胞定位

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN：

年卷期： 2021 年 009 期

页码： 2491-2499

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在分离猪PYGO2编码区序列,获悉该基因mRNA组织表达模式、蛋白质结构特征、细胞中的分布和定位,并构建蛋白相互作用网络。本研究首先利用RT-PCR从成年版纳微型猪近交系（BMI）睾丸组织中克隆PYGO2编码区序列;利用生物信息学解析其基因结构并对蛋白质进行多种功能分析,比较多个哺乳动物PYGO2的氨基酸序列同源性,构建系统进化树和蛋白质相互作用网络;然后利用qPCR技术检测PYGO2在15个组织中的mRNA表达情况;最后通过构建pEGFP-C1-PYGO2融合表达载体,转染猪睾丸细胞（ST）,确定PYGO2的亚细胞定位。结果表明,PYGO2基因CDS长1 221 bp,编码406个氨基酸（基因和氨基酸号分别为KY644518和AVB77243.1）,定位在猪4号染色体;PYGO2蛋白二级结构以无规则卷曲为主,N端和C端均疏水;氨基酸序列同源比对分析表明,猪PYGO2与其他哺乳动物的相似度均大于97%,在进化上高度保守;蛋白互作网络分析显示,猪PYGO2与9个蛋白可能存在相互作用,其中与BCL9蛋白作用最为紧密;qPCR表达分析表明,猪PYGO2在被检的15个组织中均有不同程度表达,在生殖腺中表达相对较高;ST细胞中的亚细胞定位结果表明,PYGO2 mRNA主要分布在细胞核。本研究获得了PYGO2基因的编码序列,蛋白质结构和定位,蛋白质相互作用网络,mRNA多组织表达特征,可为进一步解析该基因在猪精子生成中的分子机制提供参考。