文献类型： 中文期刊
作者： 张晓东 1 ; 李彩霞 2 ; 赵青蓉 2 ; 王元忠 3 ;
作者机构： 1.玉溪师范学院化学生物与环境学院;云南省农业科学院药用植物研究所
2.;玉溪师范学院化学生物与环境学院;云南省农业科学院药用植物研究所
3.;玉溪师范学院化学生物与环境学院;云南省农业科学院药用植物研究所;
关键词： 滇龙胆;环烯醚萜氧化酶;基因和启动子克隆;生物信息学分析;开放阅读框
期刊名称： 中草药
ISSN： 0253-2670
年卷期： 2018 年 18 期
页码： 4386-4392
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 目的从滇龙胆叶片中克隆单萜合成关键酶环烯醚萜氧化酶(GrIDO)基因及其启动子序列,并进行序列分析。方法根据滇龙胆转录组GrIDO基因序列设计基因特异性引物,使用RT-PCR方法克隆GrIDO基因的开放阅读框(open reading frame,ORF)序列,基于在线软件对GrIDO基因序列进行生物信息学分析。同时,根据GrIDO基因ORF序列,设计特异性引物,采用PCR法对该基因启动子序列进行扩增,并进行序列分析。结果 GrIDO基因(GenBank登录号KP722034)ORF全长1 557 bp,编码518个氨基酸;GrIDO蛋白相对分子质量58 920,理论等电点8.40,属于细胞色素P450超家族成员,可能定位于叶绿体;无信号肽,为亲水不稳定蛋白,主要由α-螺旋(51.07%)和环(42.69%)构成;GrIDO蛋白与长春花CrIDO蛋白具有较高的相似性(85.83%),且亲缘关系较近。GrIDO基因启动子(GenBank登录号KT428570)长720 bp,具有TATA-box和CAAT-box,还具有参与脱落酸和茉莉酸甲酯应答的顺式作用元件、光应答元件和MYB结合位点。结论GrIDO基因表达受多种因素调控。克隆了GrIDO基因ORF及其启动子,为GrIDO基因的功能验证奠定基础。
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