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三种植物EST-SSR引物在滇重楼上的通用性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨维泽 1 ; 许宗亮 1 ; 杨绍兵 1 ; 杨美权 1 ; 左应梅 1 ; 杨天梅 1 ; 张金渝 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院药用植物研究所

关键词: EST-SSR;滇重楼;通用性

期刊名称: 西南农业学报

ISSN: 1001-4829

年卷期: 2014 年 27 卷 04 期

页码: 1686-1690

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了筛选适合用于滇重楼种质资源整理、评价和遗传研究的SSR标记,首次利用百合(35对)、延龄草(10对)、薯蓣(5对)的EST-SSR标记对5份滇重楼材料进行PCR扩增,分析3种植物引物在滇重楼中的通用性。结果显示,40对引物在滇重楼中能有效扩增,占引物总数的80.0%,其中32对引物具有多态性,占引物总数的64.0%,引物通用率较高;利用15对具有多态性的引物对35份滇重楼材料进行多态性检测,等位基因数(A)、有效等位基因数(Ae)、Nei’s基因多样性(H)、Shannon指数(I)及多态位点百分比(PPB%)分别为1.9955、1.2634、0.1811、0.3075和99.5%,滇重楼显示出较为丰富的遗传多样性。3种植物的ESTSSR引物在滇重楼中具有较高的通用性,通过对3种植物EST-SSRs引物的开发,有助于重楼属在遗传多样性、基因定位、连锁图谱的构建及比较基因组学等方面的研究。

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