文献类型: 中文期刊
作者: 邓少春 1 ; 陈林波 1 ; 田易萍 1 ; 陈春林 1 ; 徐丕忠 1 ; 李朝云 1 ; 梁名志 1 ;
作者机构: 1.云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心云南省茶学重点实验室
关键词: 茶树花;转录组;SSR;荧光标记
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2018 年 18 期
页码: 6001-6008
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 本研究对204 199条茶树花转录组Unigenes进行SSR简单重复序列的查找,得到含有SSR的序列60 581个,出现频率为29.67%。EST-SSR重复类型以单核苷酸和二核苷酸为主,占总SSR比例的85.69%,其中主要重复基序类型为单核苷酸,占总SSR的47.97%,A/T重复类型出现最多。采用荧光标记PCR技术对设计合成的100对SSR引物进行引物筛选,其中有28对引物扩增条带清晰、多态性好,在4个品种的茶树花中得到有效性验证。结果表明,茶树花转录组的SSR标记开发是可行的,这些EST-SSR的开发对茶树花遗传多样性分析、分子育种和开发茶树不育相关的SSR标记等具有重要意义。
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