您好,欢迎访问云南省农业科学院 机构知识库!

基于荧光标记的茶树花转录组序列SSR标记开发

文献类型: 中文期刊

作者: 邓少春 1 ; 陈林波 1 ; 田易萍 1 ; 陈春林 1 ; 徐丕忠 1 ; 李朝云 1 ; 梁名志 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院茶叶研究所云南省茶树种质资源创新与配套栽培技术工程研究中心云南省茶学重点实验室

关键词: 茶树花;转录组;SSR;荧光标记

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2018 年 18 期

页码: 6001-6008

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究对204 199条茶树花转录组Unigenes进行SSR简单重复序列的查找,得到含有SSR的序列60 581个,出现频率为29.67%。EST-SSR重复类型以单核苷酸和二核苷酸为主,占总SSR比例的85.69%,其中主要重复基序类型为单核苷酸,占总SSR的47.97%,A/T重复类型出现最多。采用荧光标记PCR技术对设计合成的100对SSR引物进行引物筛选,其中有28对引物扩增条带清晰、多态性好,在4个品种的茶树花中得到有效性验证。结果表明,茶树花转录组的SSR标记开发是可行的,这些EST-SSR的开发对茶树花遗传多样性分析、分子育种和开发茶树不育相关的SSR标记等具有重要意义。

  • 相关文献

[1]基于荧光标记的紫娟茶树转录组EST-SSR标记开发. 陈春林,田易萍,陈林波,邓少春,徐丕忠,李朝云. 2018

[2]雌蕊缺失茶树花3个发育期的数字基因表达谱分析. 李梅,陈林波,田易萍,夏丽飞,宋维希,梁名志,江昌俊. 2017

[3]苦荞种皮转录组SSR位点信息分析及其分子标记的开发. 贺润丽,尹桂芳,李春花,王莉花,马颖榆,王梦莹,阎仕豪. 2020

[4]雄性不育东方百合转录组SSR信息分析及其分子标记开发. 王立,王有国,崔光芬,王祥宁,马璐琳,段青,杜文文,贾文杰. 2019

[5]基于数字基因表达谱分析的茶树花不育基因挖掘. 陈林波,夏丽飞,田易萍,李梅,宋维希,梁名志,江昌俊. 2017

[6]利用荧光标记高通量鉴定减数分裂重组抑制突变体. 李帆,阮继伟. 2019

[7]铽掺杂碳点的制备及其抑菌性能. 李宏,田浩,于丽娟,高哲,杨亚玲,李晚谊. 2020

[8]Genetic structure and phylogeography of rice landraces in Yunnan, China, revealed by SSR. Zhang, Hongliang,Sun, Junli,Wang, Meixing,Liao, Dengqun,Zeng, Yawen,Shen, Shiquan,Yu, Ping,Mu, Ping,Wang, Xiangkun,Li, Zichao.

[9]Verification of the introgression of Erianthus arundinaceus germplasm into sugarcane using molecular markers. Cai, Q,Aitken, K,Deng, HH,Chen, XW,Fu, C,Jackson, PA,McIntyre, CL. 2005

[10]Genetic Diversity of Populations of Saccharum spontaneum with Different Ploidy Levels Using SSR Molecular Markers. Liu, X. L.,Deng, Z. H.,Liu, X. L.,Li, X. J.,Xu, C. H.,Lin, X. Q.,Liu, X. L.,Li, X. J.,Xu, C. H.,Lin, X. Q.. 2016

[11]腾冲红花油茶蜜腺2个发育时期转录组差异性分析. 卿卓,苏睿,赵文正,李林庶,任晓晓,董坤,和绍禹. 2019

[12]外源水杨酸诱导桑叶响应紫外线胁迫的转录组变化分析. 罗正宏,周璇,赵宜婷,鲁新琪,李赛杰,韩丽,武丽霞,蒋丽,杜云龙. 2019

[13]人参种胚不同后熟发育阶段比较转录组学分析. 冷容,胡彦婷,周艳丽,金桂花,李玲,石勇,杨红,桂大萍,薛润光,章成君. 2020

[14]基于生物信息学的睡莲SSR位点特征分析. 苏群,田敏,刘俊,王凌云,李春牛,李先民,黄展文,王虹妍. 2021

[15]红芽直立茶紫色叶形成机制的转录组分析. 刘悦,曲浩,李友勇,段志芬,杨盛美,尚卫琼,矣兵,杨兴荣,孙雪梅,刘本英. 2019

[16]西方蜜蜂精子质量研究存在问题及未来研究方向探讨. 荀利杰,李琼艳,胡宗文,张学文. 2016

[17]茶树叶片响应茶饼病侵染的转录组分析. 孙云南,许燕,冉隆珣,蒋会兵,宋维希,夏丽飞,陈林波,梁名志. 2020

[18]转录组测序分析外源水杨酸诱导茶树热激蛋白基因的响应. 刘悦,曲浩,田易萍,陈春林,冉隆珣,陈林波. 2024

[19]两个柠檬品种叶片离区响应乙烯利处理的转录组分析. 董美超,尹拓,周东果,张汉尧,杨帆,王绍华,龙春瑞,付小猛,刘红明,郭莉娜,李丹萍,高俊燕. 2024

[20]基于RNA-Seq的雌蕊缺失茶树花转录组分析. 夏丽飞,陈林波,李梅,宋维希,田易萍. 2017

作者其他论文 更多>>