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滇牡丹PdANR基因克隆及表达模式分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杜春 1 ; 平怀磊 1 ; 王文治 2 ; 张平芳 3 ; 张怀壁 4 ; 王娟 5 ;

作者机构: 1.西南林业大学林学院

2.云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所

3.西南林业大学园林园艺学院

4.新西兰皇家植物与食品研究所

5.西南林业大学绿色发展研究院

关键词: 滇牡丹;PdANR;基因克隆;表达分析

期刊名称: 北方园艺

ISSN: 1001-0009

年卷期: 2022 年 024 期

页码: 42-52

收录情况: 北大核心

摘要: 以不同时期不同花色的滇牡丹花瓣为试材,采用RT-PCR技术克隆得到PdANR基因的全长cDNA序列,并利用生物信息学预测PdANR蛋白的结构特征及理化性质,结合实时荧光定量PCR(qPCR)分析PdANR基因在各色组织间的表达模式,以期为滇牡丹原花青素的相关研究提供参考依据。结果表明:PdANR基因含有一个1 011 bp的完整开放阅读框(OFR),编码336个氨基酸残基,蛋白分子量为36.46×10~3 g·mol-1,等电点为8.82,半衰期为30 h,不稳定指数为29.56,疏水指数为0.071,推测其为疏水性的稳定蛋白。同时,亚细胞预测显示该蛋白在细胞外中的分值最高。系统进化树表明,ANR蛋白具有明显的种属特性,其中PdANR蛋白与其它科植物的亲缘关系都较远。qPCR结果表明PdANR基因在花瓣、萼片及花药中均有表达,花瓣中的表达量会随着组织的发育而显著减少。

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