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余甘子转录组分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赵琼玲 1 ; 张永辉 1 ; 罗会英 1 ; 金杰 1 ; 何璐 1 ; 瞿文林 1 ; 宋子波 1 ; 沙毓沧 1 ;

作者机构： 1.云南省农业科学院热区生态农业研究所;云南猫哆哩集团食品有限公司;云南省农业科学院园艺作物研究所

关键词： 余甘子果实;转录组分析;药用活性成分;次生代谢物;基因注释

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2018 年 20 期

页码： 63-69

摘要： 为明确余甘子果实形成过程中基因表达变化及药用性状形成的可能机制,本研究采用Hiseq2500PE125测序技术对4份余甘子种质进行转录组测序,在基本生物信息学分析及表达谱基因注解的基础上,对余甘子果实形成过程中药用性状相关功能基因进行预测。结果显示:余甘子果实包含192375个Transcript,47573个unigene,平均长度1140 bp;功能基因预测比对结果显示果实中碳代谢相关的通路所占比例最多,达44.2%;氨基酸代谢(amino acid metabolism)通路441条,表明余甘子果实药用性状形成过程中碳代谢及氨基酸代谢活动较为强烈。基于余甘子药用成分为酚酸类化合物的共识,该结论为深入开展余甘子次生代谢物相关基因功能挖掘及调控机制研究奠定了基础。

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