文献类型: 中文期刊
作者: 吴转娣 1 ; 刘新龙 1 ; 刘家勇 1 ; 昝逢刚 1 ; 李旭娟 1 ; 刘洪博 1 ; 林秀琴 1 ; 陈学宽 1 ; 苏火生 1 ; 赵培方 1 ; 吴才文 1 ;
作者机构: 1.云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室
关键词: 甘蔗;ScD27;同源克隆;生物信息学;q-PCR
期刊名称: 作物学报
ISSN: 0496-3490
年卷期: 2017 年 43 卷 01 期
页码: 31-41
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 独脚金内酯(strigolactones,SLs)是一类新型植物激素,D27基因是独脚金内酯生物合成途径中最上游的调控基因,且该基因调控SLs的合成是一个可逆的过程。本研究根据水稻、玉米、高粱、二穗短柄草4种禾本科作物的D27基因核苷酸序列保守区域设计引物,以甘蔗品种ROC22的c DNA为模板,利用RT-PCR和RACE技术,从甘蔗中克隆出D27基因的c DNA全长序列,命名为Sc D27,Gen Bank登录号为KP987221.1。该基因序列全长1379 bp,包含一个867 bp的完整开放阅读框(ORF),编码288个氨基酸残基。Sc D27编码的蛋白质分子量为71.58 k D,理论等电点为5.04,是一种非分泌性蛋白,主要分布于叶绿体上,该蛋白的保守区可能具有2个锌指蛋白结构域(Zn F_TAZ和Zn F_A20),且不存在信号肽;该基因编码的氨基酸序列具有较高的保守性,与高粱、谷子、大麦、短穗二柄草等禾本科植物的D27氨基酸序列相似性在70%以上;Sc D27基因在甘蔗各组织部位均有表达,其中茎尖和腋芽中表达量较高,叶、茎和根中的表达较低。此外,Sc D27基因在甘蔗茎尖中的表达受PEG、盐胁迫、磷缺乏和营养缺乏的诱导,推测Sc D27基因是甘蔗独脚金内酯生物合成途径中响应非生物胁迫的关键基因。
- 相关文献
[1]甘蔗HD-Zip Ⅰ亚家族转录因子基因ScGT1的克隆和生物信息学分析. 李旭娟,李纯佳,林秀琴,刘洪博,徐超华,字秋艳,毛钧,陆鑫,刘新龙. 2019
[2]甘蔗ScF-box基因cDNA全长克隆和生物信息学分析. 吕爱丽,刘洪博,李旭娟,吴才文,刘新龙,曾千春. 2017
[3]中华蜜蜂气味结合蛋白基因AcerOBP14的克隆及时空表达. 杜亚丽,张中印,潘建芳,王树杰,杨爽,赵慧婷,姜玉锁. 2016
[4]番茄斑萎病毒属病毒非结构蛋白NSs的生物信息学分析. 郑宽瑜,董家红,苏晓霞,方琦,郑雪,张仲凯. 2014
[5]峨眉蔷薇Ro-DREB1C的克隆与生物信息学分析. 周宁宁,王俊云,李淑斌,陈敏,张颢,王其刚. 2018
[6]峨眉蔷薇Ro-DREB1C的克隆与生物信息学分析. 周宁宁,王俊云,李淑斌,陈敏,张颢,王其刚. 2018
[7]猪雄性增强抗原1基因MEA1编码区克隆、表达及生物信息学分析. 霍海龙,张霞,范俐,赵筱,唐宏涛,高林青,王世雄,杨云,浦仕飞,刘丽仙. 2018
[8]玫瑰与烟草间作对烟叶蛋白质影响的生物信息学分析. 徐洁,余萍,董超,朱海滨,张静,杨义,罗云,姚春馨,陶南. 2016
[9]蓖麻DNA甲基转移酶序列与基因表达分析. 代梦媛,高梅,郭丽芬,邓剑川,李文昌. 2016
[10]蓖麻NAC转录因子家族的鉴定及生物信息学分析. 代梦媛,高梅,李文昌. 2020
[11]植物抗白粉病MLO基因研究进展. 田永贤,陈敏,王其刚,张颢,邱显钦. 2020
[12]基于长尖叶蔷薇与大花香水月季转录组数据的MLO unigenes生物信息学及表达分析. 向贵生,张颢,王其刚,晏慧君,周宁宁,陈敏,唐开学,邱显钦. 2018
[13]蔷薇科植物MLO蛋白家族的生物信息学分析. 向贵生,王开锦,晏慧君,李淑斌,周宁宁,唐开学,邱显钦. 2018
[14]云南特有火把梨UFGT基因片段的克隆与序列分析. 孟富宣,周军,王大玮,陶磅,董娇,徐世宏,段淋渊. 2016
[15]茶树PIN基因家族的鉴定及表达分析. 刘玉飞,庞丹丹,李友勇,蒋会兵,陈林波. 2020
[16]不同物种Mlo基因生物信息学分析. 陈玲,邱显钦,张颢,晏慧君,王其刚,唐开学. 2012
[17]苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析. 杨晓琳,段迎,蔡苏云,贺润丽,尹桂芳,王艳青,卢文洁,孙道旺,王莉花. 2022
[18]猪睾丸表达序列37(TEX37)克隆、mRNA表达及蛋白质功能生物信息学分析. 霍海龙,张霞,范俐,赵筱,王世雄,王荣琼,刘丽仙,霍金龙. 2020
[19]甘蓝型油菜BnFAD2基因的生物信息学分析. 陈镇,何晓莹,王敬乔,李根泽,束正齐,赵凯琴,程小毛,俎峰. 2021
[20]苦荞FtHCT的基因克隆与生物信息学分析. 杨晓琳,段迎,蔡苏云,贺润丽,尹桂芳,王艳青,卢文洁,孙道旺,王莉花. 2023
作者其他论文 更多>>
-
云南八倍体割手密84-268血缘F2群体表型多样性分析
作者:俞华先;安汝东;董立华;桃联安;刘家勇;田春艳;经艳芬;郎荣斌;边芯;周清明;孙有芳;张钰
关键词:割手密;八倍体;遗传多样性;主成分分析;聚类分析
-
割手密遗传多样性研究进展
作者:任生林;胡鑫;姚丽;赵丽萍;覃伟;昝逢刚;刘家勇
关键词:甘蔗;割手密;遗传多样性;分子标记
-
大茎野生种57NG208血缘甘蔗群体F1种质叶片的叶绿素荧光特征
作者:俞华先;田春艳;经艳芬;安汝东;郎荣斌;董立华;桃联安;边芯;刘洪博;吴才文
关键词:甘蔗;大茎野生种;光合叶绿素荧光;相关分析;聚类分析
-
贵州省黔西南州甘蔗野生种质资源考察收集与表型性状初步研究
作者:徐超华;刘洪博;覃伟;毛钧;林秀琴;陆鑫
关键词:甘蔗;黔西南州;种质资源;表型性状;遗传多样性
-
云南澜沧甘蔗品种改良的成效与建议
作者:李茅苗;吴才文;张凤云;任生林;赵俊;邱若楠
关键词:甘蔗;品种改良;成效;建议
-
脉冲标记下甘蔗13C富集及氮磷钾含量变化
作者:桂意云;李海碧;韦金菊;周会;祝开;赵培方;刘昔辉;区惠平
关键词:碳同位素;甘蔗;13CO2脉冲标记;氮磷钾含量
-
美国引进甘蔗热带种的ARMS PCR真实性鉴定
作者:李旭娟;毛钧;赵培方;刘洪博;王晓燕;陆鑫
关键词:甘蔗热带种;ARMS PCR;真实性;鉴定;甘蔗育种