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甘蔗独脚金内酯生物合成关键基因ScD27的克隆与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吴转娣 1 ; 刘新龙 1 ; 刘家勇 1 ; 昝逢刚 1 ; 李旭娟 1 ; 刘洪博 1 ; 林秀琴 1 ; 陈学宽 1 ; 苏火生 1 ; 赵培方 1 ; 吴才文 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室

关键词: 甘蔗;ScD27;同源克隆;生物信息学;q-PCR

期刊名称: 作物学报

ISSN: 0496-3490

年卷期: 2017 年 43 卷 01 期

页码: 31-41

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 独脚金内酯(strigolactones,SLs)是一类新型植物激素,D27基因是独脚金内酯生物合成途径中最上游的调控基因,且该基因调控SLs的合成是一个可逆的过程。本研究根据水稻、玉米、高粱、二穗短柄草4种禾本科作物的D27基因核苷酸序列保守区域设计引物,以甘蔗品种ROC22的c DNA为模板,利用RT-PCR和RACE技术,从甘蔗中克隆出D27基因的c DNA全长序列,命名为Sc D27,Gen Bank登录号为KP987221.1。该基因序列全长1379 bp,包含一个867 bp的完整开放阅读框(ORF),编码288个氨基酸残基。Sc D27编码的蛋白质分子量为71.58 k D,理论等电点为5.04,是一种非分泌性蛋白,主要分布于叶绿体上,该蛋白的保守区可能具有2个锌指蛋白结构域(Zn F_TAZ和Zn F_A20),且不存在信号肽;该基因编码的氨基酸序列具有较高的保守性,与高粱、谷子、大麦、短穗二柄草等禾本科植物的D27氨基酸序列相似性在70%以上;Sc D27基因在甘蔗各组织部位均有表达,其中茎尖和腋芽中表达量较高,叶、茎和根中的表达较低。此外,Sc D27基因在甘蔗茎尖中的表达受PEG、盐胁迫、磷缺乏和营养缺乏的诱导,推测Sc D27基因是甘蔗独脚金内酯生物合成途径中响应非生物胁迫的关键基因。

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