您好,欢迎访问云南省农业科学院 机构知识库!

琥珀蚕线粒体全基因组测序及序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 钟健 1 ; 刘增虎 2 ; 杨伟克 2 ; 朱峰 2 ; 董占鹏 3 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院蚕桑蜜蜂研究所

2.;云南省农业科学院蚕桑蜜蜂研究所

3.;云南省农业科学院蚕桑蜜蜂研究所;

关键词: 大蚕蛾科;柞蚕属;琥珀蚕;线粒体基因组;系统发育

期刊名称: 昆虫学报

ISSN: 0454-6296

年卷期: 2017 年 08 期

页码: 936-949

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】分析昆虫的线粒体基因组能很好地指示昆虫物种的亲缘关系。本研究旨在探索琥珀蚕Antheraea assama线粒体基因组并在线粒体水平上了解大蚕蛾科(Saturniidae)属及种间的分子系统进化关系。【方法】采用PCR步移法并结合克隆测序的策略,测定了珍稀绢丝昆虫琥珀蚕的线粒体基因组全序列,分析其结构特点和碱基组成;采用邻近距离法(NJ)构建大蚕蛾科及外群共14种昆虫线粒体蛋白质编码基因的系统发育树,并分析琥珀蚕在大蚕蛾科中的系统发育关系。【结果】琥珀蚕线粒体基因组序列全长15 312 bp(Gen Bank登录号:KU301792),包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个核糖体rRNA基因和一段332 bp的A+T富集区,呈现典型的鳞翅目昆虫线粒体基因组的核苷酸组成及基因排布顺序。分析结果表明,琥珀蚕线粒体基因组中A+T含量高达80.18%,13个蛋白质编码基因中,除了COX1以CGA为起始密码子,其他均为典型的起始密码子ATN。COX1、COX2和ND5均以不完整的T为终止密码子,其余基因都是以典型的TAA或TAG为终止密码子。预测的22个tRNA二级结构中,除tRNASer(AGN)缺乏DHU臂外,其他21个tRNA均能形成典型的三叶草结构。由线粒体蛋白质基因串联序列构建的NJ系统发育树表明,琥珀蚕与柞蚕Antheraea pernyi、天蚕Antheraea yamamai、明目大蚕Antheraea frithi构成鳞翅目大蚕蛾科柞蚕属Antheraea这一分支。在9种大蚕蛾科昆虫中,琥珀蚕与柞蚕属的天蚕亲缘关系最近,与巨大蚕蛾属Attacus的乌桕大蚕Attacus atlas亲缘关系较远。【结论】琥珀蚕线粒体基因组的基因排列方式同其他已测定的鳞翅目昆虫的完全相同。基于线粒体基因组的大蚕蛾科昆虫系统发育关系与传统的形态分类学结果一致,即琥珀蚕隶属于柞蚕属Antheraea。

  • 相关文献

[1]变灰青霉线粒体基因组特征及系统发育分析. 康瑞萍,艾菲热·阿布都艾尼,周慧英,索菲娅,丁明亮. 2022

[2]采自云南省的一种野生绢丝昆虫的分子鉴定与茧质性状调查. 白兴荣,柴建萍,唐芬芬,张永红,邵榆岚,朱峰. 2016

[3]红河州野生大蚕蛾科绢丝昆虫资源调查初报. 江秀均,刘敏,储一宁,廖鹏飞,钟健. 2010

[4]印度琥珀蚕养殖技术. 钟健,江秀均,姚丽萍,朱水芬,廖鹏飞. 2012

[5]高温和低温条件下琥珀蚕血淋巴 SOD及CAT活性的变化. 杨伟克,唐芬芬,刘增虎,董占鹏,钟健. 2017

[6]利用硫氰酸锂水溶液提取云南琥珀蚕茧壳丝蛋白的适宜条件研究. 李琼艳,刘增虎,杨伟克,钟健. 2017

[7]云南省区收集琥珀蚕的mtDNA COⅠ基因克隆和系统进化分析. 钟健,江秀均,陈安利,唐芬芬,邵榆岚,柴建萍,白兴荣. 2014

[8]琥珀蚕内参基因的克隆及表达稳定性检测. 陈安利,钟健,刘增虎,李琼艳,廖鹏飞,杨伟克,董占鹏. 2018

[9]高温和低温条件下琥珀蚕血淋巴SOD及CAT活性的变化. 杨伟克,唐芬芬,刘增虎,董占鹏,钟健. 2017

[10]琥珀蚕的生物学特性. 钟健,董占鹏,江秀均,李涛,姚丽萍,刘敏,杜伟,黄平. 2013

[11]琥珀蚕成虫触角的超微结构观察. 钟健,杨伟克,和锐,刘增虎,罗顺高. 2016

[12]琥珀蚕胆绿素结合蛋白基因AaBP-1的克隆及表达分析. 李琼艳,陈安利,钟健,刘增虎,廖鹏飞,杨伟克,董占鹏. 2019

[13]不同温度和饥饿胁迫下琥珀蚕AaHsp90基因的表达特征. 杨伟克,刘增虎,唐芬芬,胡昌雄,董占鹏. 2022

[14]琥珀蚕丝腺转录因子基因AaSGF-1的克隆、原核表达及组织表达分析. 李琼艳,陈安利,荀利杰,刘增虎,廖鹏飞,杨伟克,董占鹏. 2021

[15]琥珀蚕孵化酶基因AaHE的克隆及启动子活性分析. 陈安利,董占鹏,唐顺明,刘增虎,李涛,廖鹏飞,李琼艳. 2021

[16]云南野蚕研究初报. 陈松,钟健. 2009

[17]云南野桑蚕线粒体基因组特征及系统发育分析. 张永红,李平平,邵榆岚,倪婧,刘敏,白兴荣. 2023

[18]从核糖体DNA ITS区序列研究甘蔗属及其近缘属种的系统发育关系. 陈辉,范源洪,向余颈攻,蔡青,张亚平. 2003

[19]基于amy基因的中国野桑蚕遗传多样性及其与家蚕的系统发育关系. 刘俊凤,刘斌彬,董占鹏,余泉友,鲁成,陈义安. 2009

[20]蓟马科部分种类mtDNA-COⅠ序列变异及系统发育分析. 沈登荣,宋文菲,袁盛勇,田学军,和绍禹,张宏瑞. 2014

作者其他论文 更多>>