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基于rDNA-ITS序列探讨甘蔗近缘属种的系统进化关系

文献类型： 中文期刊

作者： 刘新龙 1 ; 苏火生 1 ; 马丽 1 ; 陆鑫 1 ; 应雄美 1 ; 蔡青 1 ; 范源洪 1 ;

作者机构： 1.云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室

关键词： 甘蔗;ITS;系统进化;甘蔗亚族

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2010 年 36 卷 11 期

页码： 1853-1863

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以狼尾草属(PennisetumRich.)的象草(P.purpureum)为外群体,依据rDNA-ITS序列探讨了甘蔗亚族(Saccharinae)内与甘蔗植物分类关系较近的8属37种120份材料的系统进化关系,结果表明,ITS1序列长度为200~208bp,变异位点91个,简约信息位点70个,GC含量为60.4%~69.1%;ITS2序列长度为215~220bp,变异位点93个,简约信息位点68个,GC含量为66.1%~73.4%;5.8sDNA序列长度为164bp,变异位点18个,简约信息位点9个,GC含量为54.1%~58.0%;根据变异位点,简约信息位点占总位点的比例可以看出,ITS序列比5.8sDNA序列变异程度高,其中ITS1序列又较ITS2序列变异丰富。属种间遗传距离表明芒属(Miscanthus)和荻属(Triarrhena)与甘蔗属(Saccharum)的亲缘关系最近,其次为蔗茅属(Erianthus)和河八王属(Narenga);而莠竹属(Microstegium)、大油芒属(Spodiopogon)、白茅属(Imperata)与甘蔗属亲缘关系较远。根据甘蔗近缘属种的NJ和MP系统发育关系,支持将斑茅(E.arundinaceus)归入蔗茅属,荻属归入芒属的观点;河八王属的河八王(N.porphyrocoma)与滇蔗茅(E.rockii)亲缘关系较近,而与同属的金猫尾(N.fallax)亲缘关系较远;蔗茅属和芒属属种系统进化关系较其他属种复杂;有4份材料被发现鉴定有误,不应用于后续研究。

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