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类重金属ATP酶基因序列遗传变异分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李程鹏 1 ; 孙一丁 2 ; 刘辉 3 ; 曾千春 1 ; 王炎炎 2 ; 马继琼 2 ; 杨奕 2 ; 许明辉 2 ;

作者机构： 1.云南农业大学农学与生物技术学院

2.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所

3.中国科学院昆明动物研究所

关键词： 亚洲栽培稻;野生稻;OsHMA2-like基因;进化

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2016 年 29 卷 09 期

页码： 2009-2015

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： OsHMA2是水稻根和地上部一个主要的Zn和Cd的转运蛋白,在水稻基因组OsHMA2位点存在OsHMA2类似基因OsHMA2-like,编码蛋白包含水稻P1B型ATP酶重金属转运蛋白的功能域。对来自世界不同稻区的27份亚洲栽培稻和8份野生稻基因OsHMA2-like编码区序列进行了测序分析,以了解水稻OsHMA2-like序列的多样性,为发掘基因资源提供信息。OsHMA2-like核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,在471bp的编码序列内发现了6个变异位点;Tajima'sD检验表明均不显著,说明这些位点属中性进化状态;6个变异位点中,第15、78、132、214、417位点碱基不引起氨基酸的变异,而第457位的变异使得5个供试材料(1个O.nivara,4个ARO品种和1个粳稻品种)由于提前形成终止子在C末端少3个氨基酸,ARO类品种在此位点上与TRJ、IND、TEJ存在显著差异,这暗示ARO类品种可能由O.nivara演化而来。

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