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SSR标记在辣椒DUS测试中的应用研究

文献类型: 中文期刊

作者: 管俊娇 1 ; 余志慧 1 ; 杨晓洪 1 ; 王江民 1 ; 张鹏 1 ; 黄清梅 1 ; 张建华 1 ;

作者机构: 1.云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所;云南省农业科学院农业经济与信息研究所

关键词: 辣椒;DUS测试;SSR标记;近似品种

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2019 年 02 期

页码: 396-405

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了评价SSR分子标记在辣椒(Capsicum annuum L.)品种特异性、一致性、稳定性(DUS)测试中的应用潜力,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术和毛细管电泳技术,对辣椒SSR引物进行筛选,采用入选的30对核心引物,构建130份不同来源品种的指纹图谱。30对引物共检测到等位基因163个,每对引物等位基因变幅为2~15,平均等位基因数为5.43,多态信息量(PIC)的变异范围为0.17~0.76,平均为0.43。聚类分析表明,该套引物可以将所有参试品种区分开来,遗传基础相近的品种优先聚在一起。130个品种的遗传距离为0.01~0.91。有20对品种遗传距离小于0.10,其中3对品种有1个位点的差异,采用差异位点数判断品种特异性更适合目前辣椒品种现状。采用10对引物对品种0313963-4进行了一致性检测,综合一致性比率R值为96.5%,低于DUS测试中对表型性状一致性的要求。因此SSR标记直接用于辣椒DUS判定还需进一步研究,但是可用于近似品种筛选。

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