文献类型： 中文期刊
作者： 王立 1 ; 王有国 1 ; 崔光芬 1 ; 王祥宁 1 ; 马璐琳 1 ; 段青 1 ; 杜文文 1 ; 贾文杰 1 ;
作者机构： 1.云南农业大学园林园艺学院;云南省农业科学院花卉研究所
关键词： 东方百合;转录组;SSR;多态性
期刊名称： 西南农业学报
ISSN： 1001-4829
年卷期： 2019 年 02 期
页码： 259-266
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 【目的】对东方百合雄性不育系开展转录组测序分析,开发SSR分子标记,为东方百合雄性不育系遗传多样性研究奠定基础。【方法】利用MISA软件对筛选得到的1 Kb以上的Unigene做SSR分析,利用Primer3.0设计引物,随机选择71对引物进行多态性扩增。【结果】共获得135 483条Unigene,筛选得到12 391个SSR位点(占总Unigene的9.15%);其中SSR位点中主导类型为单核苷酸重复,占总SSR的63.94%;其次是二核苷酸重复,其出现频率为20.65%。通过Primer3.0设计得到11 948对SSR引物,随机选择71对SSR引物对24种不同来源的东方百合可育品种及雄性不育系进行多态性验证分析,结果显示在22对可扩增产物的SSR引物中,引物表现稳定可重复的多态性,各个位点的等位基因介于3～8个,平均等位基因数5个,多态信息含量PIC平均值0.5048、观测杂合度Ho平均值0.1977、期望杂合度He平均值0.4533。【结论】研究表明通过对东方百合雄性不育系转录组分析可获得较高频率的SSR位点且类型丰富,为东方百合雄性不育系遗传多样性分析和遗传图谱构建提供了候选标记。
- 相关文献
[1]款冬转录组SSR标记开发及其多态性研究. 贺润丽,韩毅丽,段静静,刘计权,王莉花. 2019
[2]基于荧光标记的茶树花转录组序列SSR标记开发. 邓少春,陈林波,田易萍,陈春林,徐丕忠,李朝云,梁名志. 2018
[3]苦荞种皮转录组SSR位点信息分析及其分子标记的开发. 贺润丽,尹桂芳,李春花,王莉花,马颖榆,王梦莹,阎仕豪. 2020
[4]基于荧光标记的紫娟茶树转录组EST-SSR标记开发. 陈春林,田易萍,陈林波,邓少春,徐丕忠,李朝云. 2018
[5]莠去津与东方百合农艺性状及生理指标的相关性分析. 王祥宁,蹇洪英,汪国鲜,毕翠花. 2009
[6]干旱胁迫对东方百合根叶生理功能及花粉育性的影响. 贾文杰,王祥宁,马璐琳,段青,杜文文,崔光芬. 2017
[7]不同光照条件下东方百合生长状态及生物量的分配. 王祥宁,熊丽,陈敏,杨永福,余明荣. 2007
[8]东方百合可育品种及其不育突变体花药形成的细胞学观察. 郑洁,王有国,崔光芬,王祥宁,蒋亚莲,马璐琳,段青,杜文文,贾文杰. 2015
[9]不同海拔地区生产的东方百合种球西伯利亚冷藏过程中生理变化的比较. 王丽花,吴学尉,杨秀梅,王继华,瞿素萍,张艺萍. 2012
[10]东方百合种球‘siberia’低温贮藏过程中的形态和生理变化研究. 王丽花,瞿素萍,王继华,汪禄祥,吴学尉. 2008
[11]不同处理方式对东方百合种子萌发的影响. 高娜,崔光芬,赖月群,郑思乡,李静,王继华,刘飞虎. 2011
[12]东方百合胚性愈伤组织诱导和植株再生研究. 张艺萍,吴丽芳,吴学尉,崔光芬,丁丁,王继华. 2008
[13]Genetic structure and phylogeography of rice landraces in Yunnan, China, revealed by SSR. Zhang, Hongliang,Sun, Junli,Wang, Meixing,Liao, Dengqun,Zeng, Yawen,Shen, Shiquan,Yu, Ping,Mu, Ping,Wang, Xiangkun,Li, Zichao.
[14]Genetic Diversity of Populations of Saccharum spontaneum with Different Ploidy Levels Using SSR Molecular Markers. Liu, X. L.,Deng, Z. H.,Liu, X. L.,Li, X. J.,Xu, C. H.,Lin, X. Q.,Liu, X. L.,Li, X. J.,Xu, C. H.,Lin, X. Q.. 2016
[15]Verification of the introgression of Erianthus arundinaceus germplasm into sugarcane using molecular markers. Cai, Q,Aitken, K,Deng, HH,Chen, XW,Fu, C,Jackson, PA,McIntyre, CL. 2005
[16]腾冲红花油茶蜜腺2个发育时期转录组差异性分析. 卿卓,苏睿,赵文正,李林庶,任晓晓,董坤,和绍禹. 2019
[17]外源水杨酸诱导桑叶响应紫外线胁迫的转录组变化分析. 罗正宏,周璇,赵宜婷,鲁新琪,李赛杰,韩丽,武丽霞,蒋丽,杜云龙. 2019
[18]人参种胚不同后熟发育阶段比较转录组学分析. 冷容,胡彦婷,周艳丽,金桂花,李玲,石勇,杨红,桂大萍,薛润光,章成君. 2020
[19]基于生物信息学的睡莲SSR位点特征分析. 苏群,田敏,刘俊,王凌云,李春牛,李先民,黄展文,王虹妍. 2021
[20]红芽直立茶紫色叶形成机制的转录组分析. 刘悦,曲浩,李友勇,段志芬,杨盛美,尚卫琼,矣兵,杨兴荣,孙雪梅,刘本英. 2019
作者其他论文 更多>>
-
不同冻干工艺对冻干米线复水品质的影响
作者：付坚;于丽娟;金鹏程;陈越;崔光芬;普红梅;王海丹;李雪瑞;李宏
关键词：米线;真空冷冻干燥;复水;微观结构;质构特性
-
秋水仙碱提取分离研究进展
作者：崔光芬;杜文文;金鹏程;段青;王祥宁;贾文杰;马璐琳;王继华
关键词：秋水仙碱;嘉兰属;提取方法;分离纯化
-
百合LoXTH23基因克隆、生物信息学分析及在鳞茎休眠解除过程中的表达动态
作者：张济民;王浩;贾文杰;孙亮;张小平;王有国
关键词：百合;LoXTH23;生物信息学分析;休眠解除
-
大丽花花粉活力及离体萌发研究
作者：段青;蔡晶晶;杜文文;杨楠;王祥宁;贾文杰;马璐琳
关键词：大丽花;花粉活力;离体萌发;培养条件;培养基组分
-
4种秋海棠花香挥发性物质测定与特征香气成分分析
作者：杜文文;段青;贾文杰;马璐琳;王祥宁;王继华
关键词：秋海棠;花香;挥发性物质;特征香气
-
百合AP2/ERF家族转录因子基因LoERF4的克隆和生物信息学分析
作者：王浩;孙亮;张济民;贾文杰;吴雅文;张小平;李想;王有国
关键词：百合(Lilium spp.);LoERF4;基因克隆;生物信息学分析
-
鸢尾属植物花器官总RNA不同提取方法的比较分析
作者：罗梦瑶;王有国;马璐琳
关键词：鸢尾;西南鸢尾;总RNA;纯度和浓度
